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做转录组测序得目的是什么
基因
测序
发展趋势
是什么
样子
答:
小RNA测序 二代绝对优势项目。长读长没有任何用。靶向外显子组测序 三代优势项目。不但可以直接读取全长,也可以分析大规模的结构变异与重排。
转录组测序
ISO-seq 以三代测序为代表的长读长测序方法。该测序的
目的是
弄清整个转录组的序列、外显子构成在基因组上的位置、可变剪切模式等。但由于三代...
基因
测序
发展趋势
是什么
样子
答:
小RNA测序 二代绝对优势项目。长读长没有任何用。靶向外显子组测序 三代优势项目。不但可以直接读取全长,也可以分析大规模的结构变异与重排。
转录组测序
ISO-seq 以三代测序为代表的长读长测序方法。该测序的
目的是
弄清整个转录组的序列、外显子构成在基因组上的位置、可变剪切模式等。但由于三代...
RNA-seq 分析之我见(一)
答:
通过上面的分析,接下来面临的问题就是,我怎么分析某一疾病状态下组织或者细胞所有RNA的表达情况,一个一个分析,肯定不现实,而且可能还有很多未被发现但是很重要的分子。怎么办?只有一个办法,
转录组测序
,即RNA-Seq, 某一条件下所有转录出来的RNA碱基序列,我都给你测出来
是什么
。那么这涉及6个步骤...
怎么知道
测序
数据是
转录组
还是基因
答:
上调或下降。先要有转录组或是基因组才可以做表达谱,否则没有Ref做参考。
转录组测序
和表达谱测序其实都是通过高通量测序技术进行的,转录组测序主要是针对没有参考基因组(即基因组未完成测序)的物种,侧重于获得你材料的全部转录组信息;而表达谱则侧重于检测各个基因的表达量。
转录组
分析怎样寻找代谢通路基因
答:
般的
转录组测序
可以得到大量差异表达基因和调控代谢通路,但由于基因与表型难以直接关联,导致关键信号通路难以确定,因此往往达不到预期研究
目的
。相信很多做过转录组测序的老师都深有体会。总感觉中间缺少了一步?没错,就是代谢物!代谢物是基因型与表型之间的桥梁,代谢物的变化更能直接揭示基因的功能,...
为
什么
要给单个细胞
测序
答:
主要是三个方面:第一样本量比较少,比如一些CTC细胞(循环肿瘤细胞),数量比较少,需要特殊扩增才能达到
测序
的要求。第二,组织有异质性,比如说我们进行癌组织的测序,取样很难保证组织细胞都为癌细胞。第三,胚胎发育过程中,研究发育过程中的基因组或者
转录组
或者表观遗传的变化。比如8细胞的时候看看...
转录组
分析怎样寻找代谢通路基因
答:
般的
转录组测序
可以得到大量差异表达基因和调控代谢通路,但由于基因与表型难以直接关联,导致关键信号通路难以确定,因此往往达不到预期研究
目的
。相信很多做过转录组测序的老师都深有体会。总感觉中间缺少了一步?没错,就是代谢物!代谢物是基因型与表型之间的桥梁,代谢物的变化更能直接揭示基因的功能,...
转录组测序
的转录组测序概念
答:
转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。蛋白质是行使细胞功能的主要承担者,蛋白质组是细胞功能和状态的最直接描述,转录组成为研究基因表达的主要手段,
转录组是
连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白...
转录组
基础--
什么
是RNA-seq
答:
直接对cDNA进行
测序
。下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS)又名高通量测序(High-Throughput Sequencing),是相对于传统的桑格测序(Sanger Sequencing)而言的。RNA-Seq即对
转录组
进行测序和分析。一般来说在研究所会委托公司测序得到数据自己进行后续的生信分析(质控,mapping,差异基因表达分析,SNV...
基因功能验证异位表达分析
是什么
答:
这种分析可以帮助科学家识别造成表型差异的分子基础,并选择目标基因进行深入研究。基因表达的常用检测方法有:实时荧光定量PCR(qRT-PCR)、基因芯片(Microarray)、表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)、基因表达系列分析(Serial Analysis of Gene Expression,SAGE)和
转录组测序
(RNA-seq)。目前高...
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