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做转录组测序得目的是什么
转录组测序
和表达谱测序的区别
是什么
答:
转录组测序和表达谱测序的区别:
转录组测序是
RNA水平测序,相当于DNA水平的基因组测序,是一个框架。表达谱主要研究的是基因表达量的变化,上调或下降。先要有转录组或是基因组才可以做表达谱,否则没有Ref做参考。转录组测序和表达谱其实都是通过高通量测序技术进行的,转录组测序主要是针对没有参考基因...
为
什么
要给单个细胞
测序
?
答:
有些是为了看组织细胞比如干细胞或者癌症细胞,或者神经元的
转录组
或突变的不均一性;有一些是因为目标细胞的数量较少。
基因
测序
将如何发展?
答:
该
测序
的
目的是
弄清整个
转录组
的序列、外显子构成在基因组上的位置、可变剪切模式等。但由于三代测序本身建库和测序的特点,导致它无法定量(不同的SMRT Cell,不同长度reads之间难以normalization)。RNA-seq 以二代测序为代表的短读长测序方法,由于可以做RNA定量,将仍占有一席之地。但由于RNA-seq原先...
转录组
研究技术主要有
答:
转录组研究技术主要有的如下:1、表达序列标签技术:通过PCR方法检测细胞在特定生理条件下表达的基因。2、全长
转录组测序
技术:能够检测细胞中所有基因的表达情况。3、表达量分析技术:主要用于定量分析基因的表达水平,其中qPCR是一种常用的技术。4、序列比对法:利用同源序列比对参考基因组上已知的基因的CDS...
转录组测序
和RNA-seq的不同
是什么
答:
转录组测序
与 RNA-seq前期实验样本的处理是没有差别的,主要是测序量的不同及生物信息侧重点的不同,相对来说,转录组测序适合于大物种及基因组参考序列相对来说较差的物种,以及无参考基因组的物种,而RNA-seq 更适合于参考基因相对明确,一般只想寻找基因表达差异的物种样本。现在的生物信息领域RNA-seq...
转录组测序
里面的基因覆盖度怎么来的
答:
上调或下降。先要有转录组或是基因组才可以做表达谱,否则没有Ref做参考。
转录组测序
和表达谱其实都是通过高通量测序技术进行的,转录组测序主要是针对没有参考基因组(即基因组未完成测序)的物种,侧重于获得你材料的全部转录组信息;而表达谱则侧重于检测各个基因的表达量。
为
什么
用单细胞
测序
测了
转录组
以后还要测常规转录组
答:
这是为了获得更准确的结果。因为每个细胞都是独1无2的,不同类型的细胞激活特定组合的机制,即使是同类型细胞,基因表达也会出现差异。单细胞
测序
解决了用组织样本测序或样本少时无法解决的细胞异质性难题,为科学家研究解析单个细胞的行为、机制、与机体的关系等提供了新方向。
转录组
数据定量归一化
答:
转录组测序
的终极
目的是
基于表达量来发掘背后的生物学问题,问题是表达量真的准确吗?序列偏好、cDNA反转录、文库PCR扩增、测序扩增等都会增加解读数据的难度。如何解释常规转录组数据面需要解决的问题比较多,不仅仅是定量这一个方面。忽如一夜春风来,最近各个科服大厂都在讨论转录组UMI定量的事情。UMI正...
RNA测序与整个基因
组测序
相比有
什么
优势?
答:
通常用于寻找差异表达基因以及发现新基因。而基因
组测序是
整个基因组都测,不管转录不转录,通常用于基因组组装,重测序进行基因分型等。这是根本不同的两个东西,一个是测
转录组
,一个是测基因组,它们的不同就是转录组和基因组的不同。至于优势,根据自己的
目的
来判断吧。欢迎追问。
测序
相关知识总结
答:
高通量
测序
技术(High-throughput sequencing,HTS)是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变,一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing,NGS )足见其划时代的改变, 同时高通量测序使得对一个物种的
转录组
和基因组进行细致全貌的分析成为...
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