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做转录组测序得目的是什么
什么是转录组
分析
答:
转录组分析指对细胞内所有转录产物的集合的分析。转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。
转录组测序
一般是对用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)进行亲和纯化的RNA聚合酶II转录生成的成熟mRNA和ncRNA进行高...
转录组
不验证有意义吗
答:
不验证没有意义。
转录组测序
的研究对象为特定组织细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,主要包括mRNA和非编码RNA。转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点,通过新一代高通量测序,能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,已广泛应用于基础研究...
...
转录组测序
与RNA-seq(quantification) 有
什么
区别,从原理上和适用性...
答:
转录组测序
与 RNA-seq前期实验样本的处理是没有差别的,主要是测序量的不同及生物信息侧重点的不同,相对来说,转录组测序适合于大物种及基因组参考序列相对来说较差的物种,以及无参考基因组的物种,而RNA-seq 更适合于参考基因相对明确,老师只想寻找基因表达差异的物种样本,如拟南芥 等 。
什么是转录组
学?
答:
转录组
研究可以帮助我们了解细胞在不同生理状态下的基因表达情况,以及基因表达的调控机制。通过对转录组的研究,可以发现新的基因及其功能,深入了解细胞的生长、发育、代谢等生命活动过程。二、转录组研究的内容 1、转录本的鉴定 通过高通量
测序
等技术,对细胞中的转录本进行鉴定和筛选,获取完整的RNA序列...
常规
转录组测序
和数字基因表达谱测序(RNA-seq)有
什么
不同?初接触,很多...
答:
基本
目的是
类似的。不同之处在于
测序
的模板序列,前者是直接随机测序cDNA库,后者是先把模板按照一定方法打断(例如酶切或其他),只从打断位置开始测序,测序片段短,但相应深度更高。如果你已经有参考基因组,使用所谓“表达谱”测序是可以的。此外,表达谱方法更便宜,但个人觉得适用性不如
转录组
广泛,...
转录组是什么
意思啊?
答:
转录组
研究可以帮助我们了解细胞在不同生理状态下的基因表达情况,以及基因表达的调控机制。通过对转录组的研究,可以发现新的基因及其功能,深入了解细胞的生长、发育、代谢等生命活动过程。二、转录组研究的内容 1、转录本的鉴定 通过高通量
测序
等技术,对细胞中的转录本进行鉴定和筛选,获取完整的RNA序列...
什么是转录
本?有什么作用呢?
答:
转录组
研究可以帮助我们了解细胞在不同生理状态下的基因表达情况,以及基因表达的调控机制。通过对转录组的研究,可以发现新的基因及其功能,深入了解细胞的生长、发育、代谢等生命活动过程。二、转录组研究的内容 1、转录本的鉴定 通过高通量
测序
等技术,对细胞中的转录本进行鉴定和筛选,获取完整的RNA序列...
转录组
的优势
答:
相对于传统的芯片杂交平台,
转录组测序
无需预先针对已知序列设计探针,即可对任意物种的整体转录活动进行检测,提供更精确的数字化信号,更高的检测通量以及更广泛的检测范围,是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。
转录组
名词解释
答:
转录组
研究可以帮助我们了解细胞在不同生理状态下的基因表达情况,以及基因表达的调控机制。通过对转录组的研究,可以发现新的基因及其功能,深入了解细胞的生长、发育、代谢等生命活动过程。二、转录组研究的内容 1、转录本的鉴定 通过高通量
测序
等技术,对细胞中的转录本进行鉴定和筛选,获取完整的RNA序列...
什么
实验适合
做转录组
答:
取样实验适合
做转录组
。
转录组测序
关键是取样,选择合适的处理以及对照。除测序数据量外,还有很多指标可以衡量转录组测序质量的,如rRNA消除比例、测序duplicated reads的比例、每个转录本的测序均一性、测序的可重复性、不同GC或不同长度转录本的表达丰度是否存在偏移等。区别 全面快速地获取某一物种特定...
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