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做转录组测序得目的是什么
测序
小知识之名词解释
答:
3、Long-read 长读长:
测序
得到的超过1000 bp的reads,本文中代表全长或近乎全长的mRNA。4、Direct RNA sequencing (dRNA-seq): 直接测序RNA而非cDNA的测序技术,通常用于测序全长或近全长的mRNA 。5、Multi-mapped reads 多重比对的reads:从
转录组
同源区域测序得到的reads,不能精确确认其转录本或...
如何来设定
转录组测序
中的生物学重复
答:
如何来设定
转录组测序
中的生物学重复 1.区分生物学重复与技术重复 生物学重复:指样本重复,比如3只小鼠,同时做一种处理,就是三个生物学重复。技术重复:一般是三次实验,比如对一块组织,提了三次RNA,做三次real time。2.设置生物学重复的意义 由于新一代测序技术的优越性以及高成本,曾一度忽略...
转录组测序
两个重复怎么得到最后的means
答:
转录组测序
两个重复怎么得到最后的means 1.区分生物学重复与技术重复 生物学重复:指样本重复,比如3只小鼠,同时做一种处理,就是三个生物学重复。技术重复:一般是三次实验,比如对一块组织,提了三次RNA,做三次real time。2.设置生物学重复的意义 由于新一代测序技术的优越性以及高成本,曾一度...
转录组
定量工具-featureCounts安装及使用
答:
我们
做转录组测序
,不就是想看基因水平的变化吗,我觉得这是很好的一个参数设置,不知道为
什么
网上一堆的帖子都没有这样设置,官网上示例也只是-t exon。希望未来有人和我讨论一下这个问题。最终:我基于自己的理解,加上-t gene -f参数了。1 、运行过程情况: ...
一代
测序
,二代测序,三代测序的优点缺点分别
是什么
,求大神赐教
答:
一代测序,二代测序,三代测序的优点缺点分别介绍如下:一代测序优点是读长较长、准确性高。缺点是测序成本高、通量低,使得de novo测序、
转录组测序
等应用难以普及。二代测序优点是相比一代测序大幅降低了成本,保持了较高准确性,并且大幅降低了测序时间,将一个人类基因组从3年降为1周以内。缺点是...
什么是转录组
数据释放
答:
对RNA
测序
数据进行解读和解析的过程。
转录组
数据释放就是对RNA测序数据进行解读和解析的过程有数据预处理、表达矩阵构建、差异表达分析。
测序
中的PE
是什么
意思?
答:
产出的数据量相对较小。- PE300测序适用于一些需要更长的读长以获得更全面信息的研究,如全基因组测序、
转录组测序
等。而PE250测序适用于一些对数据量要求不是很高的应用,如目标区域测序、外显子组测序等。选择使用哪种测序平台,需要根据具体的研究
目的
、数据需求和预算来进行考虑。
有没有懂
转录组测序
或者做过的朋友
答:
有没有懂
转录组测序
或者做过的朋友 样品要求: ⑴样品纯度要求: total RNA OD值应在1.8至2.2之间;电泳检测28S:18S至少大于1.5;⑵样品浓度: total RNA浓度不低于400ng/ul;样品总量不低于15ug;⑶请提供total RNA样品具体浓度、体积、制备时间、溶剂名称及物种来源。请同时附上QC数据,包括电泳胶...
想做原核
转录组测序
,请问有哪家公司推荐吗
答:
做转录组测序
,其实市面上的公司都可以,现在实力都差不多,不过如果做原核的,我推荐你去金唯智,他家可以做先菌种鉴定,我刚开始第一次送样的,先做了菌种鉴定,发现样品不对,又重新制备的样品,幸亏做了,要不然麻烦就大啦。
PE300
测序是什么
? PE250测序又是什么?
答:
产出的数据量相对较小。- PE300测序适用于一些需要更长的读长以获得更全面信息的研究,如全基因组测序、
转录组测序
等。而PE250测序适用于一些对数据量要求不是很高的应用,如目标区域测序、外显子组测序等。选择使用哪种测序平台,需要根据具体的研究
目的
、数据需求和预算来进行考虑。
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