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做转录组测序得目的是什么
转录组
学分析的流程?
答:
高通量
测序
:将构建好的文库进行高通量测序,可以使用NGS技术。测序得到的数据将成为后续分析的基础。数据分析:对测序数据进行生物信息学分析。这包括数据预处理、比对到参考基因组或
转录组
的序列、表达量计算、差异表达基因分析、功能富集分析、聚类和表达模式分析等。结果解释和验证:解释分析结果并进行验证...
二代
测序
文库构建-概述与挑战(1)
答:
对于RNA文库,我们需要根据
测序目的
来进行文库构建方案的筛选。如果
目的是
发现复杂全面的转录事件,文库需要覆盖整个
转录组
,包括,编码、非编码、反义以及基因间RNA,而且需要尽可能的完整。但是,很多场合,目的只是研究能够翻译成蛋白质的编码mRNA的转录本。另一种情况只涉及small RNA,大多miRNA,也包括snoRNA,piRNA,snRNA以及...
有没有人做过植物方面的
转录组测序
答:
做过植物方面的
转录组测序
转录组学(Transcriptomics)是一门在整体水平上研究细胞中基因转录情况及转录调控规律的学科。转录组(Transcriptome)广义上指某一生理条件下细胞内所有转录产物的集合,狭义上指所有mRNA的集合。转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的必然纽带,转录组研究已经成为揭示生物生长发育调控...
转录组测序
结果里deseq2,ebseq,noiseq
是什么
意思
答:
NOIseq/EBseq/DEseq2是三种不同的计算差异基因的方法,主要用于组间的差异基因分析。
做转录组测序
以后,还需要进行怎么样的分
答:
首先需要做的是将测出来的reads mapping到基因组上,与此同时可以得到数据mapping比例等信息,依靠这些信息可以进行数据质量的分析,然后还可以统计每个基因的表达情况,如果是比较不同样本之间的
转录组
,则可以进行差异表达基因的分析
WGCNA分析--提升
转录组测序
文章档次的利器
答:
现在
做转录组测序
,看看差异基因,
做做
富集分析,再讨论下差异基因功能与自己研究性状或处理之间的关系,最后加简单的qPCR验证,这样的数据发SCI影响因子越来越低了。必须增加新的分析内容才能有所突破。今天给大家介绍一个能给文章增色的分析内容--基因共表达网络分析(WGCNA),该分析对样品数有一定要求,建议不少于15个,不...
转录组
数据绘制PCA图以及生物学重复的相关问题
答:
很久没有跟新啦~~~忙着基金。。基金。。还是基金,然后就是文章。。文章。。还是文章。终于有空整理之前的东西。说绘图方法之前先要了解,转录组的PCA图的意义
是什么
?为了检测样本之间的离散程度,也就是重复之间差的大不大。1、绘图之前先解答样本重复的问题。
转录组测序
一般情况下需要是三个重复。
没生物学重复的
转录组
数据以
什么
为准
答:
这种做法的问题在于:不同地区的人数目不同,身高不同,以地区的平均值代表该地区的平均身高,然后将不同地区的人汇聚起来计算,这样忽略了人口数
目的
权重,从而导致整个群体的平均身高被拔高或者降低,最后得到的结论也是不可靠的。现在开始进入正题,假设我要通过
转录组测序
的方法比较拟南芥叶片在阳光下和...
转录组测序
名词解释
答:
转录
的解释 遗传信息从脱氧 核糖核酸 到核糖核酸的转移。即以脱氧核糖核酸为模板,合成核糖核酸的过程。 词语分解 转的解释 转 (转) ǎ 旋动:转动。转瞬(转动 眼睛 , 形容 时间 短促)。 改换方向或情势:转身。转变。转弯。 不 直接 的,中间再 经过 别人 或别的地方:转送。转达。转...
转录组测序
流程步骤是哪些?
答:
以真核
转录组测序
为例,实验流程为总RNA提取-mRNA分离-建库试剂-定量-文库回收-桥式扩增-上机测序;项目分析流程为数据产出数据=数据去杂-转录组拼接-SSR分析及SNP分析-基因功能注释-基因表达差异分析-差异基因表达模式聚类-差异基因富集分析。
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