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转录组测序的分类
转录组测序
之各类样品如何取样
答:
我们将常见转录组测序的样品分为五大类: 植物、动物、血液、微生物和互作类型
,不同的类型对于取样方法和要求不尽一致,下面就一一介绍一下。1. 植物组织 :植物组织一般要求重量大于 4g。首先我们要准备好液氮预冷的无酶管,并做好取样器械的消毒和去RNA酶处理,尽量选取新鲜幼嫩、生长旺盛部位的样本...
聊聊
转录组测序
——1.RNA测序概述
答:
RNA测序主要分为转录组测序、小RNA测序和环状RNA测序
,每种类型针对的目标分子不同。至于成本差异,主要受数据量、测序平台和文库类型影响。数据量越大,价格越高;不同的测序平台如HiSeq X Ten、MiSeq和BGISEQ-500,成本差异明显。文库类型的选择,特别是去除核糖体RNA的方法,对价格有显著影响,但也能...
转录组
研究技术主要有
答:
6、RNA-Seq:通过高通量
测序
技术,反映RNA的表达水平。7、基因表达系列分析技术:是一种高通量、大规模的基因表达分析技术。8、微阵列技术:用于大规模基因组表达谱研究、快速检测基因差异表达。
转录组
简介与
分类
:转录组简介:广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、...
有个关于
转录组测序的
问题
答:
包括基于sanger测序法的sage (serial analysis of gene expression)、longsage和mpss(massively parallel signature sequencing);基于杂交技术的cdna芯片和寡聚核苷酸芯片;基于高通量测序技术的
转录组测序
(rna-seq)。与另两种方法相比,rna- seq具有以下优势:高灵敏度,检测阈值跨越6个数量级,能检测到...
真·高通量单细胞全长
转录组
答:
1. 以10x Genomics 为代表的3‘/5’
转录组测序
: 本方案对转录本一端进行测序,可以满足一般的转录组定量分析需求,细胞通量高,测序成本相对较低,缺点是一般只能检测到转录本3‘/5’端600nt以内的信息,其他信息丢失了;2. Smart-seq: 本方案将cDNA打断后,对转录本的所有...
正常的
转录组测序
包含小rna吗
答:
转录组测序的
方法很多,而RNA-seq是当前转录组测序的一种测序方法,又称为二代测序,包括454,solexa等。RNA-seq即转录组测序技术,就是把mRNA,smallRNA,and NONcoding RNA等或者其中一些用高通量测序技术把它们的序列测出来。反映出它们的表达水平。样品要求:⑴样品纯度要求: total RNA OD值应在1.8...
转录组
是什么,
测序
是什么,有什么用?
答:
转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。
转录组测序
一般是对用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)进行亲和纯化的RNA聚合酶II转录生成的成熟mRNA和ncRNA进行高通量测序。相对于传统的芯片杂交平台,转录组测序...
转录组测序
和单细胞
测序的
区别有哪些?
答:
转录组测序
和单细胞测序是两种常用的基因组学技术,它们在研究基因表达和细胞异质性方面有所不同。以下是它们的一些主要区别:样本
类型
:转录组测序通常使用组织样本或细胞系等大量细胞的总RNA进行分析,而单细胞测序则从单个活细胞中获取RNA,可以解析细胞个体之间的差异。RNA捕获方式:转录组测序常用的方法是...
全
转录组的测序
和芯片技术
答:
尽管如此,全
转录组测序
,如NGDC的测序数据,如NPJ Breast Cancer中的exLR-seq研究,揭示了不同组间的转录本差异,尽管数据量并不包含针对非编码基因的独立fastq文件。真正的全转录组学测序,如《Molecular Cancer》中的研究,对喉鳞癌和癌旁正常黏膜组织提供了全面的分析,包括miRNA、circRNA、lncRNA和...
转录组测序
和RNA-seq的区别是什么
答:
转录组测序的
方法很多,而RNA-seq是当前转录组测序的一种测序方法,又称为二代测序,包括454,solexa等。RNA-seq即转录组测序技术,就是把mRNA,smallRNA,and NONcoding RNA等或者其中一些用高通量测序技术把它们的序列测出来。反映出它们的表达水平。数字基因表达谱升级版(RNA-Seq)是用来研究某一生物...
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