大明养兵权和用兵权分开的，现在只有美国分开，所以跟我们通常理解的军队模式不太一样。
养兵的：
五军
都督府（分中、左、右、前、后5个）：每个管理几个省的军队。左、右都督为
正一品 都指挥使司（行都指挥使司、留守司），管理一省军事（都指挥使司和
承宣布政使司地域上有差别），都指挥使正二品。行都司和都司设置一样，留守司较小。明朝共设都指挥使司16个（其中13个和明朝13个省（即13个承宣布政使司）一致，剩下的三个为大宁都司、万全都司和辽东都司），5个行都司（较大或者任务较重的省份除都司外另设行都司，和都司并列，各领部分地区，为山西行都司、陕西行都司、四川行都司、福建行都司、
湖广行都司）和2个留守司（中都留守司和兴都留守司）。
上直卫属于皇帝，不受五军都督府管辖。但是
土木堡之后，除
锦衣卫、御马监直属四卫（腾骧左、右卫，武骧左、右卫）总共5个卫依旧在皇帝手中外，其余二十余卫均被兵部控制。
京卫直属五军都督府，北京卫归北京五军都督府，南京卫归南京五军都督府。北京各卫集中操练，设三大营（五军营、三千营和神机营），是为精兵屯于京师。
都指挥使司下属各卫和直属千户所（数量不一，多的一般为16-20卫+20-33所）。
卫指挥使司，管理一个卫，一个卫5个千户所，5600人。卫指挥使为正三品。一个千户所1120人，设正五品千户，辖10个百户所，设正六品百户，百户所112人，下两个总旗（50人）共10个小旗（10人）
用兵的
兵部：六部之一，文官领兵，尚书为正二品文官，明朝同品秩文官比武官高很多。
兵部负责武官晋升、考核、选拔，扶着作战调度，派遣总兵等官职
总兵官：管理一方作战指挥任务，多则20-30万人，少者几千人，无品，由都督、公侯充任。总兵官带
虎符，挂将军印信，称将军。明朝初期，总兵官遇战事才设立，战争结束后交兵回朝，兵归地方。后期因为战事频繁，就常设共18个总兵官，北方京师周围较多（有6个）。
副总兵：协助总兵官，管理一个方向的几路作战。
参将：管理一路作战，一般手里有6000-20000人
游击将军：管理机动作战力量，一般3000-5000人
守备：驻防一城一地，手下一般有1000多人
把总：小城镇的军队作战领导，一般北方一个小县城设两个把总，一个把总大约统领100-150人。
以上官职都没有品秩。总兵官、副总兵、参将一般都是五军都督府的正一品都督、从一品都督同知、公侯伯或者皇亲充任。
还有按任务的，分为镇守、协守、分守、守备、备御、备倭等等，还有提督、提调这样的说法……是动词，不是官职。所以正是的叫法为：
镇守****（比如“
蓟州”）总兵官 ； 协守****副总兵；分守*****副总兵；分守****路参将；
****府守备；****县把总。
明朝的军队归属地方，由都指挥使司统领，五军都督府统筹。战时由兵部选择挂帅将军，出任总兵等官职，由各地都指挥使司抽调各卫所兵力供总兵官率领，作战粮草供给要由出兵的地方提供。战争结束后，总兵把军队归还各指挥使司，封印回京。
皇帝御驾亲征时，以三大营为主力，五军营为中军，神机营围绕五军营为外围，三千营负责巡哨，并由锦衣卫提供皇帝的贴身保护。五军营
马步皆有，三千营为骑兵，神机营为火枪火炮兵，三大营总共兵力近20万人，在明朝前期无可匹敌，待到土木堡，一朝损失殆尽。后虽恢复建制，武宗时期由选过十二团营，但是其实力一直没有回复巅峰。后期，军队腐化，失去战斗力，知道后来明末未战而降。于是中国近代以前的一直最先进武装（特别是神机营），就这样退出历史舞台，甚至终结了中国
冷兵器部队的
近代化之路。