1、县级以上卫生行政机关负责查处所辖区域内的违反卫生法律、法规、规章的案件。
2、省级卫生行政机关（省疾病预防控制中心）可依据卫生法律、法规、规章和本地区的实际，规定所辖区内管辖的具体分工。
3、卫生部负责查处重大、复杂的案件。
4、上级卫生行政机关可将自己管辖的案件移交下级卫生行政机关处理；也可根据下级卫生行政机关请求处理下级卫生行政机关管辖的案件。
5、两个以上卫生行政机关，在管辖发生争议时，报请其共同的上级卫生行政机关指定管辖。
6、卫生行政机关发现查处的案件不属于自己管辖，应当及时书面移送给有管辖权的卫生行政机关。受移送卫生行政机关应当将案件查处结果函告移送的卫生行政机关。受移送地的卫生行政机关如果认为移送不当。应当报请共同的上级卫生行政机关指定管辖，不得再自行移送。
7、上级卫生行政机关在接到有关解决管辖争议或者报请移送管辖的请示后，应当在十日内作出具体管辖决定。 1、两个以上卫生行政机关，在管辖发生争议时，报请其共同的上级卫生行政机关指定管辖。
2、卫生行政机关发现查处的案件不属于自己管辖，应及时书面移送给有管辖权的卫生行政机关。受移送卫生行政机关应当将案件查处结果函告移送的卫生行政机关。受移送地的卫生行政机关如果认为移送不当；应当报请共同的上级卫生行政机关指定管辖，不得再自行移送。
3、上级卫生行政机关在接到有关解决管辖争议或者报请移送管辖的请示后，应当在十日内作出具体管辖决定。 1、国境卫生检疫机关依据国境卫生检疫法律、法规实施的行政处罚，由违法行为发生地的国境卫生检疫机关管辖。
卫生部卫生检疫局负责查处重大、复杂的案件。
卫生部卫生检疫局下设的国境卫生检疫机关间对管辖发生争议时，报请卫生部卫生检疫局指定管辖。
2、法律、法规规定的受卫生部委托的有关部门的卫生主管机构，或由卫生部会同其规定监督职责的国务院有关部门的卫生主管机构，负责规定管辖范围内的案件。
3、卫生行政机关与第十二条所指的有关部门的卫生主管机构对管辖发生争议的，报请省级卫生行政机关指定管辖。
