1.不同水质
纯净水是干净的，不含杂质和细菌，而矿泉水含有一定量的矿物盐、微量元素或二氧化碳气体。
2.不同的生产流程
纯水是通过电渗析、离子交换、反渗透、蒸馏等适当的处理方法制得的，而矿泉水则是直接从地下或通过钻井采集。
3.不同的成分
纯净水是不含微量元素的普通水。纯净水可以补充身体机能，促进人体新陈代谢，提高人体免疫力等。但在去除水中有害杂质的同时，也去除了几乎所有对人体有益的微量元素和矿物质。矿泉水含有多种微量元素，饮用矿泉水可以补充人体多种微量元素。
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