叶用枸杞抗逆性比较强，但也有少数病虫害发生，主要有蚜虫、枸杞瘿螨、炭疽病、根腐病、白粉病等。
（1）枸杞瘿螨 是危害较严重的一种螨类害虫，以口针刺吸危害枸杞叶片与嫩枝为主，刺激受害部位的细胞增生，形成包状瘤瘿，螨在瘤瘿内寄生、繁殖和危害。严重影响到叶用的品质与商品外观。春季萌芽前是防治最适期，可采用45%～50%的硫黄胶悬剂300倍稀释液或用3～5波美度石硫合剂清园，还可兼治其他螨类；秋冬季全园大清剪时将危害严重的枝条清出园外集中烧毁；虫害发生期用40%乐果1000倍稀释液喷洒。
（2）蚜虫 危害嫩茎或嫩叶，吸取植株汁液，可用50%抗蚜威可湿性粉剂4000倍液或10%吡虫啉3000倍液喷洒。每7～10天喷一次，连喷1～2次。
（3）根腐病 一般4～6月开始发生，7～8月较严重。在植株根颈部开始发病，初期植株局部皮层腐烂，后期整株失水而萎蔫。防治上应注意田间排涝，防止积水；中耕时，不要碰伤植株，避免病菌从伤口侵入；及时拔除感病植株，并在其周围撒施生石灰、喷洒托布津等杀菌剂预防。
（4）白粉病 主要危害叶片和嫩枝。防治上应加强田间管理，收获后及时处理病残体，栽植密度适宜，必要时修剪疏枝以利于通风透光。发病初期及时喷60%菌可得600倍液或者15%三唑酮可湿性粉剂2000倍液，每隔7～10天喷一次，喷施2～3次。