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真核有参转录组测序选择6G raw data还是选择8G raw data?
如题所述
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第1个回答 2017-08-17
转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特定细胞或组织在特定状态下的基因表达种类和丰度信息,这样编制成的数据表就称为基因表达谱
追问
您能更直观的说下分为6,8的原因吗。在测序时,怎样去选择,万分感谢
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cleandata比
rawdata
小太多
答:
原因如下: 一般来说,测序仪下机的数据称为
raw
data
,经过以下两步处理之后变成了clean data才能用于数据分析:(1) 去除含有接头的Reads;(2) 去除低质量的Reads(包括去除N的比例大于10%的Reads;去除质量值Q≤10的碱基数占整条Read的50%以上的Reads)不过raw data和clean data并没有一个权威的定...
转录组测序
时,
raw
data
指是测序仪上下来的数据,那Clean data指的是...
答:
一般来说,
raw
data
经过以下处理之后叫clean data 1,去掉低质量的reads 2,去掉包含接头(adaptor)的reads 3,去掉包含N过多的reads
求助,
转录组测序
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raw
data
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