骨骼结构分为有机质和无机质，而蛋白质是骨骼有机质的主要成分，由此形成骨骼的“内支架”。蛋白质就像是混凝土建筑物中的钢筋，而骨骼中的矿物质则像“水泥”。若骨的“钢筋”（有机基质）不足，则“水泥”（骨矿物质）也无从沉积，就会影响建筑物（骨骼）的强度。进一步研究表明，蛋白质缺乏可通过几条途径影响骨质：一是使软骨细胞和成骨细胞合成有机基质的能力减低；二是使肠道蛋白质合成减弱及吸收功能减退；三是造成激素缺乏，如胰岛素及胰岛素样生长因子等缺乏。通过这3个途径蛋白质直接或间接影响着骨质，因而蛋白质缺乏必然会导致骨质疏松的发生。