1、显存大小不同：GTX1060的6G显卡显存大小自然比3G的显卡显存大一倍，由于显卡性能更强，相比3G版本，6G版本在绝地求生游戏中表现出平均大约20%左右的领先优势。
2、核心数量不同：6GB版用的是GP106-400核心，而3GB版用的是GP106-300核心，最突出的改变就是SM单元从10组减少到9组，GUDA单元从1280个下降到1152个，显存位宽是基本保持不变。但是由于GPU规格的变化，GTX 1060的3GB版会比6GB版还是相差很多的。
3、价格不同：GTX1060的6G独显比3G版本是贵，其实GTX1060的3G独显也能够带动大多数的一些主流游戏了，只不过相比GTX1060的6G版本其FPS会稍微差一点。
参考资料来源：百度百科-GTX1060 3G
参考文章：GTX1060的3G与6G独显的区别,不要再为了省钱后悔啦！评论说的太对了！
一、两者区别详解：
1、核心规模
6G版的核心规模（渲染器数量）是1280个，3G版的核心规模是1152个，在频率、架构等因素完全相同的条件下，两个版本的核心的性能差距是10%，这个差距在任何情况下都存在。
2、显存大小
6G显存与3G显存，显存的差距只有在显存大于3G的应用上才能体现，显存占用低于3G的程序无法体现出两个版本显卡在显存方面的差距。例如某些游戏在1080p分辨率中高画质时显存占用是5G，这时用3G版1060就会明显感受到迟滞感和卡顿，而6G版1060仍然保持丝般顺滑流畅，这就是俗称的“暴显存”。数据化显存方面的差距就是100%。
二、总结
1、6G版1060的图形处理器性能高出10%，6G版1060的显存高出100%。
2、选购依据用户自身使用场景，还有预算来确定。例如主要是玩网游，那么最近的将来主流网游的显存占用都不会超过3G，可选购3G版1060，如果主要是玩单机大作，那么去年和今年的单机大作就已经能占用4G以上的显存，所以应该选购6G版1060。某种程度上说3G版1060的性价比更高，但是在预算充足的情况下还是建议入6G版的1060，毕竟可遇见的未来2年，很多大作都能爆掉3G显存。
1.对于一些预算不多的小伙伴来说，GTX1060 3G版比6G版便宜400元左右，省下的钱基本够买机械键盘和鼠标了。但一些小伙伴有担心3G影响游戏性能，因此往往比较纠结。以下是这两款显卡的详细参数对比：
从参数对比来看，同为GTX1060的3G和6G版主要是流处理器数量和显存大小不同，其它方面则是完全一样的。在同架构显卡中，一般显存大小与流处理器越多，性能就越强。显然，就性能来说，价格更贵一些的GTX1060 6G肯定比3G更强。
2.GTX1060 3G和6G显卡做工用料完全相同，两者除了性能有差异外，在其它方面基本是完全一样的，包括架构、核心频率、PCB板设计、散热器、供电规模的用料与做工等方面，另外连功耗都是完全一样的。
GTX1060 6G显卡
GTX1060 3G显卡
参考资料
电脑百事网.电脑百事网[引用时间2018-1-3]
本回答被网友采纳1、核心规模
6G版的核心规模（渲染器数量）是1280个，3G版的核心规模是1152个，在频率、架构等因素完全相同的条件下，两个版本的核心的性能差距是10%，这个差距在任何情况下都存在。
2、显存大小
6G显存与3G显存，显存的差距只有在显存大于3G的应用上才能体现，显存占用低于3G的程序无法体现出两个版本显卡在显存方面的差距。例如某些游戏在1080p分辨率中高画质时显存占用是5G，这时用3G版1060就会明显感受到迟滞感和卡顿，而6G版1060仍然保持丝般顺滑流畅，这就是俗称的“暴显存”。数据化显存方面的差距就是100%。
二、总结
1、6G版1060的图形处理器性能高出10%，6G版1060的显存高出100%。
2、选购依据用户自身使用场景，还有预算来确定。例如主要是玩网游，那么最近的将来主流网游的显存占用都不会超过3G，可选购3G版1060，如果主要是玩单机大作，那么去年和今年的单机大作就已经能占用4G以上的显存，所以应该选购6G版1060。某种程度上说3G版1060的性价比更高，但是在预算充足的情况下还是建议入6G版的1060，毕竟可遇见的未来2年，很多大作都能爆掉3G显存。
但gtx1060 3GB显存是硬伤 玩游戏会因显存瓶颈 导致游戏效能 帧率下降严重
而gtx1060 6GB很少会出现显存瓶颈 游戏运行稳定
一分价钱一分货 玩游戏还是建议购买6GB版1060