企业文化的分三个层次结构：精神文化、制度文化、物质文化。精神文化是基础，是核心，是企业文化的内容实质，制度文化和物质文化是在精神文化基础上表现出来或形成的形式和结果。
1、精神层文化（理念层文化）
精神层文化主要是指企业的领导和员工共同信守的基本理念、价值标准、职业道德及精神风貌，它是企业文化的核心和灵魂，是形成企业文化的物质层和制度层的基础和原因。精神层文化也称为理念层文化，核心理念包括企业的愿景、使命、核心价值观、企业精神、企业道德、企业作风等；各个模块的理念整合：品牌理念、营销理念、服务理念、用人/人才理念、品质理念等。
它是企业经营管理的指导思想，是企业价值观的集中表现，是企业之“魂”。有的企业也将其所有的理念统称为“企业哲学”。有没有精神层，是衡量一个组织是否形成自己的企业文化的主要标志。
2、精神层的中间层（制度层）
制度层文化，是指具有本企业文化特色的各种规章制度、道德规范和行为准则的总称，也包括企业内部长期形成的企业风俗，反映出特定企业组织的“游戏规则”。
制度层文化是企业文化理论研究与企业实际运作结合最紧密的部分，具有将精神文化转化为物质文化的功能，它属于企业文化的中间层。企业制度层有的也称之为行为层文化。
一般制度：各组织普遍存在的管理制度；如人事管理制度（有的融入《员工手册》当中）。
特殊制度：组织特有的一些制度，如员工评议干部制度、干部员工平等对话制度、总结表彰制度等。
组织风俗：它是指组织内部长期形成、约定俗成的典礼、仪式、风俗活动等。
3、精神层文化（外显层）
物质层又可以称为器物层，是企业文化在物质上的体现，是企业创造的看得见、摸得着的直观物质文化，反映出企业的大众传播形象。
企业生产的产品和提供的服务是企业生产经营的成果，它是企业物质文化的首要内容。其次是企业创造的生产环境、企业建筑、企业广告、产品包装与设计、员工服饰等，它们都是企业物质文化的主要内容。
物质文化：这是企业文化最直接的体现，包括企业的建筑、环境、设备、产品、服务等外在表现形式。物质文化是企业文化的物质基础，是企业向外界展示形象的重要途径。
制度文化：这是企业文化的核心部分，包括企业的组织结构、管理体制、规章制度、员工行为规范等。制度文化是企业文化的制度保障，是企业内部管理的基石。
精神文化：这是企业文化的精神内核，包括企业的价值观、使命、愿景、企业精神、企业道德等。精神文化是企业文化的灵魂，是企业发展的动力源泉。