如何根据总RNA量选择OBB Buffer和Oligotex Suspension的加入量?

如题所述

使用Oligotex mRNA Kits (QIAGEN)进行mRNA的分离,首先准备工作如下:



    将Oligotex Suspension在37℃水浴中溶解并混匀,室温保存。
    OBB Buffer同样在37℃水浴中溶解并重溶沉淀,室温备用。
    OEB Buffer则置于70℃待用。

试验步骤分为以下几步:



    取Total RNA,不超过1mg,用移液器取适量到1.5ml离心管中,加RNase-free水至500ul。
    根据表3加入相应体积的OBB Buffer和Oligotex Suspension,轻轻混匀后,于70℃水浴中3分钟,室温静置10分钟。
    离心13000rpm,2分钟,移除上清,保留至polyA结合。
    沉淀物用400ul OW2 Buffer混匀,转移到Spin Column中,RT条件下离心1分钟。
    重复此过程,分别加入400ul OW2和OER Buffer(70℃),离心1分钟。
    测OD值,并通过电泳定量。

对于磁珠法分离,步骤如下:



    在RNase-free管中加入0.1~1.0mg总RNA,加RNase-free水至500ul,65℃加热10分钟。
    加入标记的Oligo(dT)和20×SSC,室温放置10分钟。
    配置0.5×SSC和0.1×SSC,将磁珠SA-PMPs分散,进行磁性分离,清洗磁珠3次。
    将混合物加入磁珠,轻轻摇匀,磁性分离后洗涤,收集mRNA。
    通过0.1×SSC洗涤,再用RNase-free水分散磁珠,洗脱mRNA。
    磁珠悬浮于RNase-free水中,重复操作,收集mRNA并可能进行浓度浓缩。

在操作过程中,务必严格遵守手套和口罩的使用,根据RNA质量和杂质情况,选择Oligotex或磁珠方法。mRNA的电泳图会呈现smear特征。


扩展资料

以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。

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