查账。
工资基数大于社保基数部分走其他应付款时，大于部分不能入成本费用账，如果偶尔超过这么走还行，如果时间长，数额又大，将来也是个事，公司注销时地税局负责查社保部分，查账时就看应付职工薪酬工资部分同缴社保部分是否吻合，如果是就不需补交，如果被查出来，即使亏损，资不抵债也得补交。
个税申报注意事项
《个人所得税法实施条例》对自行申报的起点定为年所得12万元，实行一刀切的做法，看似公平，实际上却是不公平的，不能体现量能负担原则。我国幅员辽阔，各地区经济发展极不平衡，两个收入相等但处于不同地区的重点纳税人。
由于所处环境、物价水平不同，所承担的实际费用不同，其实际收入即实际所得不同，应承担不同的税收，相应的自行申报起点也应有所区别。我国个人所得税采用国外很少采用的纯粹分类所得税制，最大问题是极易使收入相同者由于所得来源不同而导致税负不同。
以上内容参考 百度百科-个税申报、人民网-公积金缴存基数与个人所得税汇算额不一致
温馨提示：答案为网友推荐，仅供参考
第1个回答 推荐于2017-09-30
社保的计费工资一般一年一变动，确定一个基数，一年之内都不改变，但一年的总额应该和申报个人所得税的计税工资一致。但实际工作中往往不一致，这是社保这一块的工资基数管理监督还不到位，很多单位总是以最低基数缴纳社保，而劳动部门大多也不查
计算社保费用的工资基数与用人单位申报的职工工资数额在实践中往往不一致，其也是为了少缴纳社保费用与企业所得税。但社会保险法从今年七月一日起实施后，这种现象应当有所改变，至少在重庆会有改变的。因为几个行政部门会联合执法了，若发现有问题可能会对企业年检造成影响的。
计算社保费用的工资基数与用人单位申报的职工工资数额在实践中往往不一致，其也是为了少缴纳社保费用与企业所得税。但社会保险法从今年七月一日起实施后，这种现象应当有所改变，至少在重庆会有改变的。因为几个行政部门会联合执法了，若发现有问题可能会对企业年检造成影响的。
第2个回答 2012-02-03
不来查就没事，来查就要补 另外如果你社保汇算清缴补上的话也可以追问
请问一下，社保还要汇算清缴的吗？
追答我们这边每年一季度都要对上年社保费进行结算申报。我们公司社保基数都是按最低标准交的，所以每年结算都要补交
追问你们那边是哪里？我从来没弄过社保结算申报的。是在社保证年检的时候弄的吗？我司是08年成立，09年及10年会计事务所都没帮我们年检。
本回答被提问者和网友采纳第3个回答 2012-02-03
社保申报基数可以根据企业情况安当地最低标准缴纳，追问
但是我曾经问过税局，他们说要两边的数据要一致
第4个回答 2012-02-13
没什么后果 大多数无良企业都是这样的
相似回答