struts/struts2或spring mvc会用一个，也有可能自己封装一个mvc框架，完全看自己的熟练程度和喜好，对项目质量影响较小。
hibernate很强大也很难用好，一般的用mybatis比较折中，工作量大一点，但不容易犯错。
spring几乎是必用的，用来整合各种第三方技术也很方便。
这只是主流体系，还有些重量级的要用EJB之类的，不好直接比较，根据人手水平和实际需要选择。
其他框架如web service框架, jms, mina,缓存框架之类的多如牛毛，都按需选择，难以一一比较
做WEB还要考虑前端的jquery,extjs之类的js框架，无论是从复杂度还是兼容性上考虑，写原生js代码已经不怎么可取了
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