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BLAST中的E值是什么意思
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推荐答案 推荐于2016-02-20
一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值。那么这个E value是什么呢?
S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相似的程度越大。
E值就是S值可靠性的评价。它表明在随机的情况下,其它序列与目标序列相似度要大于这条显示的序列的可能性。所以它的分值越低越好。
E值的计算:
E=Kmn(e-lambda*S)
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BLAST中的E值是什么意思
答:
E值就是S值可靠性的评价
。它表明在随机的情况下,其它序列与目标序列相似度要大于这条显示的序列的可能性。所以它的分值越低越好。E值的计算:E=Kmn(e-lambda*S)
blast
比对结果
中的e值
与p值关系的公式为___。
答:
e值表示在随机情况下,我们期望看到与查询序列相似度达到或超过实际比对结果的序列的数量
。e值越小,比对结果的可信度越高。e值的计算考虑了比对得分和数据库大小,以反映在给定的数据库大小下,出现高得分比对的概率。p值则是在具体的数据库搜索中,随机出现与查询序列相似度达到或超过实际比对结果的序列...
psi
blast
搜索怎么判断是否假阳性
答:
一般来说,E值越小,说明比对的结果越可靠。如果一个比对序列的E值非常高,可能意味着该比对是假阳性。
2. 反馈轮数(iteration):PSI-BLAST是一个迭代搜索工具
,它会经过多轮的比对来找到最可靠的结果。如果一个比对序列只出现在前几轮的比对结果中,并且在后续的比对中消失了,那么可能是一个假阳性...
ncbi
blast中的e值
越大越好吗
答:
E值(Expect):表示随机匹配的可能性
,E值越大,随机匹配的可能性也越大。E值接近零或为零时,具本上就是完全匹配了。故E值越小越匹配,越小越好。
blast中的e值是
多少较好
答:
小于10-5。BLAST是英语BellLabsLayeredSpaceTime的缩写,是一项新的通信技术。
blast中的e值是
小于10-5比较好,是比较可性的S值结果。E值表示随机匹配的可性,E值越大,随机匹配的可性也越大。
请问NCBI dna
BLAST
结果中Max score、Total score、E value、Query Cove...
答:
E value:是期望值或
E值
,表示当在一个特定大小的数据库中搜索时,我们期望看到多少条序列能够获得同样的得分值,如E=1则可解释为在一个与刚才搜索数据库大小相近的数据库中随机搜索,我们期望还能找到1条与本序列得分相同或十分相近的序列。E值越接近0,表明该条目得分的显著性就越高,就越有可能与...
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