请问NCBI dna BLAST结果中Max score、Total score、E value、Query Coverage、Max Ident 分别什么意思

Question

请详细说明，谢谢，

Answer 1

Max Score（最高分）和Total Score（总分）：表示检索结果中命中序列的最高分和总分。分数越高，表示命中序列与查询序列（也称做Query）的亲缘关系就越近，当最高分和总分不同时，表示命中序列有多个不同的片段与查询序列相匹配。最高分表示命中序列中得分最高的片段。总分表示所有片段得分的总和。
Query Cover：表示咱们所查询的序列（query）与命中序列的匹配程度（也可理解为覆盖程度）。
E value：是期望值或E值，表示当在一个特定大小的数据库中搜索时，我们期望看到多少条序列能够获得同样的得分值，如E=1则可解释为在一个与刚才搜索数据库大小相近的数据库中随机搜索，我们期望还能找到1条与本序列得分相同或十分相近的序列。E值越接近0，表明该条目得分的显著性就越高，就越有可能与查询序列同源。E值在判断命中序列与查询序列是否同源时非常有用。

Answer 2

NCBI在线Blast的图文说明

本文详细出处参考：http://liucheng.name/475/

参考资料：http://liucheng.name/category/bioinformatics/

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