骶椎腰化的具体发病原因目前尚不明确，科学界对此尚未达成共识。尽管脊柱的正常发育过程相当复杂，涉及多个阶段和多个椎体的分化、愈合，但骶椎腰化的发生似乎与这个过程中的某些异常因素有关。
正常情况下，脊柱由颈椎、胸椎、腰椎、骶椎和尾椎组成。椎体和椎弓的化骨中心、侧部的附加成骨中心在胚胎早期开始形成，具体时间为第4至7周，第10周、第20周和第30周各阶段逐渐出现。出生后至8岁，椎体、椎弓和侧部的连接逐渐完成，椎弓的愈合在7至15岁之间，而椎体的上、下骺板和附加成骨中心的形成则在15岁左右，直至18岁时开始融合，至30岁时，5节骶椎整合成一个骶骨。
然而，在这个发育过程中，如果某些因素干扰了正常进程，可能会导致椎体的异常融合，进而形成骶椎腰化。这些可能的因素包括遗传、营养不良、感染、创伤或其他尚未明确的环境因素。对这些潜在因素的深入研究将有助于我们更好地理解骶椎腰化的发病机制和预防措施。