1、起源不一样
萧姓最早起源可追溯于夏朝，南齐、南梁、西梁三朝的国姓，是辽朝的后族姓氏。
肖姓金文中“赵”大部分写作“肖”，所以古肖（读赵音）姓基本上都是赵姓，如“相邦赵戈”写作“相邦肖戈”。
2、两姓人数不同
萧”与“肖”都是很古老的姓，春秋时两姓就已并行。但二者不同的是，“萧”姓两千多年来一直在使用，而“肖”姓在汉代以后却难寻踪迹。
现在全中国内所有姓“肖”者中有99%均系原来姓“萧”者。 半个世纪前，“萧”姓很多，“肖”姓则罕见。
3、祖宗不同
一般认为，肖姓是萧姓的俗称。萧姓是当今中国姓氏排行第三十位的大姓。
但也不可否认，历史上确又曾经寥若晨星地冒出过“肖”姓，尽管非常罕见，或出于某少数民族，或因故由“萧”演变而来的。
扩展资料
萧氏起源
据本氏族谱（此为今湖北省监利县等地支系所存族谱）记载：萧氏得姓始祖名叔字太心，为微子十三世孙。
微子，帝乙长子，纣王之兄，名启。周成王时，微子代续殷，受封于河南商邱，国号宋，即清之河南归德府商邱县。因其传至十余世，先后产生了孔、戴、皇甫、华、萧等姓氏，故为河南宗派之祖，我族尊之为发姓祖。
自微子下传，至太心公以前，萧氏祖先皆有名无姓。太心公为“微子十三世孙，光公之子，生周平王时。庄王三十五年，宋大夫南宫万弑君闵公而立公子游。公仗义率宋室载武宣穆庄五公之子孙，以师伐之，杀其党南宫牛及子游等，而立公子御说是为桓公。
又将猛获南宫万等醢之，以平乱有功，遂封食采萧邑，今徐州萧县是也，为宋附庸。惠王七年，公朝于周，加封萧邑为萧国，因封赐姓，是为萧姓得姓始祖，地属古之沛郡，故为沛郡宗派。
其它说法：
1、出自大禹贤士伯益后裔。据有关资料所载，古代嬴姓各部族首领伯益之后作士于萧，便以萧为姓，其后代延袭姓萧。
起源可追溯到3000多年前的殷商时期。据史籍记载，伯益是个很能干的人，舜时曾负责掌火，“烈山泽而焚之”，使禽兽逃匿，开辟了许多农田；又跟随禹跋山涉水疏通河道，救万民于水火。
伯益的巨大功绩使他的子孙得到封赏，其中一个叫孟亏的，被分封至萧地（今安徽省萧县西北），建立了萧国，并以国为氏。萧孟亏是萧姓第一人。
2、出自子姓，以国为氏。据《元和姓纂》、《古今姓氏书辨证》等有关资料所载，为周代宋国微子启的后裔。
《通志·氏族略》：“萧氏，古之萧国也，其地即徐州萧县，后为宋所并，微子之孙大心平南宫长万有功，封于萧，以为附庸，宣十二年楚灭之，子孙因以为氏。”
《元和姓綦》也持此说。由于宋微子是殷商后裔，而萧国是由微子之孙大心所建，故萧姓源流可追溯到上古圣君商汤。后世萧姓大多认可此一说法。
3、出自少数民族改姓或被赐姓，得姓萧。据《续通志·氏族略》、《姓氏词典》、《古今姓氏书辨证》等有关资料所载，汉朝时巴哩、伊苏济勒、舒噜三族被赐姓萧，两晋南北朝时契丹巴哩、伊苏济勒、部噜三氏改姓萧。
据《辽史·列传·后妃》记载：“太祖慕汉高皇帝，故耶律兼称刘氏，以乙室、拔里比萧相国，遂为萧氏。”辽后族以兰陵为郡望，并自称其先祖是兰陵人，把自己附会为西汉宰相萧何的后裔。
据《续资治通鉴》记载，有辽一朝“姓氏止分为二，耶律与萧而已。”可见契丹各族中萧姓群体的规模是相当可观的。
4、外姓改入。据台北萧氏宗亲会印行的《兰陵世家·萧、钟、叶三姓本是一家》记载，宋朝有一将军名钟达，为奸臣所害，抄斩九族，他有七个儿子，其中三个死里逃生，为避害而分别改姓萧、叶。
但此说多有破绽，存疑。此外，金、元时期，在我国北方流播的太一教中，因创教人姓萧，一些非萧姓嗣教者被改为萧姓。
参考资料来源萧氏族谱_百度百科
但传说 北宋 时 河南 有萧姓 一支 改为 肖姓（与 辽 萧太后 萧家 好像 有点故事）