唐贞观二年（628年），契丹举部降唐，本地属契丹大贺氏部落联盟。贞观二十二年（648年），唐以大贺氏8部为基础设立10州，并置松漠都督府（今西拉木伦河北岸林西县樱桃沟古城址），本地隶属之。万岁通天元年（696年），松漠都督李尽忠叛唐自立，松漠都督府遂废，此后本地属突厥。开元三年（715年），契丹首领李失活率部归唐，唐于翌年复置松漠都督府，本地隶属松漠都督府，总辖于营州东夷都护府。开元二十五年（737年），契丹大贺氏部落联盟瓦解，契丹贵族涅里（又作泥里或雅里，耶律阿保机七代祖）重建遥辇氏部落联盟，本地为涅里亲领的迭剌大部，仍隶于松漠都督府。天宝十四年（755年），唐朝发生“安史之乱”，此后本地辖于回纥汗国近百年。回纥汗国被黠戛斯推翻后，于武宗会昌二年（842年），契丹遥辇氏部落联盟在其首领屈戌的率领下重归于唐，唐视契丹为属国，承认屈戌可汗地位，授以“奉国契丹之印”。当时本地称“西楼”，为契丹“总知军国事”的于越王所在地。 本旗为辽上京临潢府所在地。唐天佑四年（907年），总管契丹部落联盟兵马大权的于越王耶律阿保机，经过部落选举的仪式取代了遥辇氏世为契丹可汗的地位，于正月庚寅在本地即皇帝位，是为辽朝开国之始。辽朝在本地的行政建置有京、府、州、县四级：
上京：为辽朝首都，位于今林东镇南故城。始建于辽太祖神册三年（918年），初称皇都，太宗会同元年（938年）更名为上京，并置临潢府。
临潢府：为上京道之治所，设于上京皇城内，领36500户，辖府、州军、城25，统县10，其中1州、1城、10县在本旗境。临潢府直属10县为属人之制，无辖域，治所均设在京城之内，县民布于京城四周。
临潢县：治所在上京皇城内，县民散居潢水之北，其地宜植，以燕、蓟汉人俘户置。
长泰县：治所在上京皇城内，县民多为渤海人，居京西北与汉人杂处。
定霸县：治所在上京汉城内，县民为渤海人，与汉人杂处，分地耕种。
保和县：治所在上京汉城内，县民为渤海人，散居京南。
潞县：治所在上京汉城内，县民为燕蓟汉人，与渤海人杂处，布于京东。
易俗县：治所在上京汉城内，县民为辽东渤海人，居于京北。
迁辽县：治所在上京汉城内，县民为辽东诸县渤海人，多为渤海王兵勇家属，居于上京东北。
渤海县：以辽阳叛民徙置。
兴仁县：治所在上京汉城内，县民不详。
宣化县：治所在上京汉城内，县民本为辽东神化县徙民，统和八年（990年）又实以诸宫提辖司人户，隶于彰愍宫。
以上10县徙置民户时间不等，建县时间同在圣宗开泰二年（1013年）四月。
祖州：天成军，上节度。原为辽太祖四代先人出生地，建城后号曰祖州，是为太祖奉陵邑，位于上京西50里，遗址在今石房子林场后山。祖州直属长霸、咸宁二县。
长霸县：以龙州长平县民徙置。
咸宁县：以辽阳长宁县民徙置。州东南20里有辽太祖伯父于越王述鲁的私城。
后金天聪二年（1628年），巴林部脱离北元归附后金。天聪八年（1634年），后金在硕翁科尔地方，为已归附的蒙古诸部划定牧地，始将巴林部划定在今巴林左右二旗及林西县的地面上。崇德元年（1636年）九月，巴林部被编成两个牛录旗，由巴林台吉阿玉石和满珠习礼分领，本地属满珠习礼旗。旗下辖牛录17个（约三个半甲喇），有兵丁5100人（其中甲士360人），共880户。顺治五年（1648年），又在牛录旗的基础上将巴林部编为巴林2旗，本地为巴林左翼旗，下辖16佐，隶于昭乌达盟。是为本地建旗之始。乾隆三十九年（1774年），清政府置乌兰哈达厅，本旗隶属之。乾隆四十三年（1778年），升热河厅为承德府，改乌兰哈达厅为赤峰县，本地汉民隶属赤峰县。 民国初年沿袭清末建置。民国12年（1923年），热河巴林垦务局林东垦务分局设立，本旗开始大量放垦蒙荒。随着巴林2旗汉族人口的逐年增多，遂有建县之举。1925年，于本旗贝子庙建立林东设治局，代行县政，隶于热河特别区。1932年8月，林东设治局正式升为林东县。自此，本地实行“属人主义”的旗县并存体制，旗辖原巴林左翼旗未垦之地，仍隶昭乌达盟；县辖巴林左右2旗全境，隶属热河省。
1933年3月1日，日本侵占林东，本地沦陷。同年7月，撤销林东县，废除蒙旗札萨克制度，建立伪巴林左翼旗公署，隶于伪满兴安西分省（1934年11月改称兴安西省）。1943年10月1日，伪满洲国并兴安各省为兴安总省，本旗伪旗公署隶属之。
1945年8月10日，日本侵略者败逃，伪旗公署垮台。13日，由林东地区上层人士和子章、马真吾等人组建了林东维持会，维护地方治安。
1945年12月1日，撤销林东维持会，由和子章组建了地方临时行政机构巴林左翼旗政府。1946年6月1日，中共热北地委于本旗建立第一个人民政权——林东行政委员会，和旗政府同属于热河省昭乌达盟行政委员会。1947年11月25日，林东行政委员会与巴林左翼旗政府合并，改称巴林左翼旗政府，隶属于热河省昭乌达盟政府。
1949年5月1日，巴林左翼旗随昭乌达盟划归内蒙古自治区。 1954年3月，巴林左翼旗人民政府改称巴林左旗人民委员会。
1968年2月，成立巴林左旗革命委员会。
1969年7月1日，巴林左旗随昭乌达盟划归辽宁省。1979年7月1日，巴林左旗随昭乌达盟重新划归内蒙古自治区。
1981年7月，撤销巴林左旗革命委员会，恢复巴林左旗人民政府名称。
1983年10月，实行市管县行政体制，昭乌达盟改为赤峰市，巴林左旗隶属之。至今。
