（1）征收对象不同：房产税是在房产用于经营的时候征收的，如房产用于自己经营工厂、商铺，或用于出租，都要缴纳房产税。土地增值税是在土地或者地上建筑物发生转让时，按照土地增值额征收的。如发生房产转让时，应按相关规定计算土地增值额，在按土地增值额征收土地增值税。城镇土地使用税与房产税类似，是土地或地上建筑物用于经营是征的。如当房产用于出租时，出征收房产税外，还要按土地的面积征收城镇土地使用税。
（2）计税方式不同：房产税是按照房产原值或租金征税。土地增值税是按照土地增值额计税。土地使用税是按照土地面积征税。
1.房产税：你租了一间房子或是你自己的也行，用于经营，月租金500元(自己的房子也要做价)按12%的税率计算500元x12个月x12%=720元(是一年的税金)。
2.土地使用税：你的房子占地面积(有土地使用证的按使用证，没有的按实际丈量的面积计算)是100平方米你应交的税金就是100x6元(每个城市不一样)=600元(是一年的税金)。
(3)个人房产问题：个人非营业用即自住住房免征土地使用税和房产税。但转做经营用的，自从经营之日起，要征收房产税，但依然不征收土地使用税。
拓展资料：无出租使用问题：免税单位无论使用什么土地房产，自用的均不交纳土地使用税和房产税。纳税单位无论是有出租使用即需交纳房租使用还是无出租使用即不交纳房租使用纳税单位或免税单位的房地产，均要交纳土地使用税，房产税。这里千万要注意房产税是要交纳的，而且要以当期出租同类房产平均租金计算房产税由使用人交纳。
法律依据：《中华人民共和国城镇土地使用税暂行条例》第二条在城市、县城、建制镇、工矿区范围内使用土地的单位和个人，为城镇土地使用税（以下简称土地使用税）的纳税人，应当依照本条例的规定缴纳土地使用税。
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