腐熟的有机肥一般需要两个阶段，即第一次高温堆肥腐熟发酵阶段和第二次陈化阶段。不稳定的有机物通过腐熟过程，通过微生物作用下，转化成稳定的腐殖质。其温度变化可以界定是否腐熟。
先说说第一阶段：通过配比原料基质，肥堆高氧吸收，产生高温，可降解挥发性固体大量减少，臭味逐渐降低，肥堆颜色逐渐变化，需保持良好的曝气和水分控制。
二次堆肥：温度初见降低，氧气吸收率降低，臭味完全消失。
相对于第一次堆肥腐熟来说，不能没有第二次堆肥，因为二次堆肥可以降解难降解的有机物，嗜温微生物菌落重新建立，从而有助于有机肥腐熟、减少植物毒性物质和抑制病原菌。
温度升高阶段：有机肥腐熟温度上升到45℃，主要以放线菌、真菌和细菌为主，主要分解糖类和淀粉。甚至有源生物动物和动物参与。
高温阶段：腐熟温度达到45℃以上，嗜温微生物被抑制，嗜热主导。可溶解的有机物继续被氧化分解，复杂的有机物（纤维素、半纤维素、蛋白质、木质素）也开始被分解。50℃左右（嗜热真菌和放线菌）；60℃左右（嗜热细菌和放线菌）；70℃左右（大多微生物已经不能适应）。
最佳腐熟温度为55℃，这是因为大多微生物在该温度最活跃，最易分解有机物，病菌、虫卵、杂草种子大多数会被杀死。
降温降低阶段：嗜温微生物又开始大量繁殖，占据优势，对残余难分解的有机物作进一步分解。此时微生物活性下降，堆肥腐熟需氧量降低，温度下降，肥堆逐渐趋于稳定。
作者：盛世火龙果
定义
有机肥俗称农家肥，是指含有大量生物物质、动植物残体、排泄物、生物废物等物质的缓效肥料。有机肥中含有富含大量有益物质，包括：多种有机酸、肽类以及包括氮、磷、钾在内的丰富的营养元素。不仅能为农作物提供全面营养，而且肥效长，可增加和更新土壤有机质，促进微生物繁殖，改善土壤的理化性质和生物活性，有机肥是最全面的肥料。
有机肥的发酵历史
有机肥发酵已经有上百年的历史，最初的发酵是无添加剂发酵，即自然堆肥发酵，当前在广大农村还有采用这种发酵方法的。自然堆肥，操作简单，成本低;但相应地发酵速度慢，肥效差(不能完全释放)，腐熟不完全，施肥之后很容易出现二次发酵，烧根烧苗，造成不必要的经济损失。逐渐，这种自然堆肥被人们摒弃，越来越多的农户开始使用加入发酵剂做有机肥。加入有机肥发酵剂后，肥料腐熟程度提高，肥效得到释放，并且不会出现二次发酵，避免烧根烧苗，且病虫害减少。
目前较好的有机肥的腐熟方法是高温堆肥。高温堆肥的方法如下：
1、物料配比。新鲜粪便5吨(最好是新鲜粪便，新鲜粪便发酵效果优于老粪便)，加入1公斤有机肥发酵剂，发酵剂需与作物秸秆按1：5的比例混匀后，再均匀撒入粪堆，混拌均匀。
2、水分调节。发酵物料的水分应控制在50-60%。其简单判断办法为：将拌好的发酵物料紧抓一把，指缝见水印但不滴水，松开落地即能散开为适宜。夏季分水稍多，以防氮肥灰化。冬季宜少，以免因通气不良而发热缓慢。
3、物料建堆。在做堆时不能做的太小太矮，太小会影响发酵，堆肥的高宽各1.5-2米，长度不限。以上的堆发酵效果比较好。并且在堆的顶部用木棒打孔通气，要深到堆底。
4、启动温度。启动温度应在15以上较好(四季可作业，不受南北方季节气候气温的影响，冬天尽量在室内或大棚内启动发酵)。
5、翻堆通气。发酵过程注意适当供氧与翻堆。温度升至60_70或以上时要及时翻倒，一般需要翻倒2-3次。堆温应保持在60-80之间，不能超过80，以防高温将肥粪中的有益菌杀死，严重时还会出现闷堆、烧堆的情况发生。
6、发酵完成。一般情况下物料呈黑褐色，温度开始降至常温，粪肥无臭无味时表明发酵完成。
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