1、农户之间发生宅基地权属争议，当事人双方应尊重历史，相互谦让，协商解决问题，双方协商成功，最好签订协议。双方达成的协议，不得违反有关法律、法规，不得损害国家、集体的利益和其他村民的合法权益；
2、协商不成的，当事人任何一方或双方可到当地乡镇政府或土地管理所等受理机关提出处理申请；
3、如果乡镇不受理，当事人双方可直接向县政府或国土局申请，若符合受理条件，可指定受理或直接受理。受理机关对受理的宅基地权属争议，可先行调解，调解无效的，应当作出处理决定；
4、当事人对处理决定不服的，可在收到处理决定通知之日起15日内向上一级处理机关申请复议，也可以在接到处理决定后30日内，直接向人民法院起诉。
一、宅基地纠纷调解程序如下：
1、向县级以上人民政府土地管理部门或者乡级人民政府提出书面申请；
2、双方当事人出示举证的材料和依据；
3、工作人员现场调查材料和取证；
4、组织双方当事人进行调解，制作书面调解书；
5、调解为达成协议的，或者调解书送达前一方或者双方反悔的，土地管理部门及时提出处理意见，报人民政府错处处理决定。
二、可以申请宅基地的情形如下：
1、年满20周岁的本村村民，因结婚等原因确需建设新房分户缺少宅基地的，包括男方到女方落户的；
2、因发生或者防御自然灾害、实施村庄和集镇规划以及进行乡镇村公共设施和公益事业建设或因国家建设征用土地等原因需要搬迁的；
3、外来人口落户，成为本集体经济组织成员，没有宅基地的；
4、城镇居民经县级以上人民政府批准回原籍落户，农村确无住宅的；
5、县级以上人民政府规定的其他条件。
法律依据：《中华人民共和国土地管理法》 第十四条 土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。
单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。
当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。
在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。
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