法律分析：劳动者在试用期内只工作三天的，劳动者有工资，用人单位应该按工作的天数支付工资。依据劳动部印发的“关于贯彻执行《中华人民共和国劳动法》若干问题的意见”第四十条规定：劳动者依据劳动法第三十二条第一项解除劳动合同(在试用期内解除劳动关系)，用人单位可以不支付经济补偿金，但应按照劳动者的实际工作天数支付工资。所以在试用期内辞职，用人单位必须要支付劳动者工资。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》 第三十条 用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。