你说的旷工是否是旷工后而离职，即自离；这类情况在企业相当多，特别是年后、节后员工不来上班的。企业可以做的是将工资支付期延长（在法定的工资支付期内），如有年终奖的话可以考虑分期发放、简化离职办理手续，缩短离职手续办理期限等。公司的规章制度先要符合法律规定的条件（合法、民主、公开）才有效，否则就算规章制度中有规定也没用。
《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；（二）严重违反用人单位的规章制度的；（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；（五）因本法《中华人民共和国劳动合同法》第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；（六）被依法追究刑事责任的。《中华人民共和国劳动合同法》第五十条用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。