一、细胞毒作用 补体通过经典途径和旁路途径的激活导致靶细胞的溶解。这种补体介导的溶菌、溶细胞作用是机体抵抗病原微生物感染的重要防御手段。补体系统激活后可使各种
血细胞、病毒感染细胞及病原微生物等各种靶细胞裂解。其中对革兰氏阴性苗的溶菌作用比对
革兰氏阳性菌的溶菌作用大得多，这可能与其细胞的结构有关。某些
自身免疫病可引起自身细胞的裂解，从而导致自身组织的损伤，也与补体的参与有关。
二、调理作用和免疫粘附作用
抗原和抗体形成免疫复合物后，可与两条激活补体的途径中形成的C3b结合，即抗原-抗体-C3b，再借助吞噬细胞和
红细胞表面的CR而与细胞结合，即C3b一端与免疫复合物结合，另一端与具有C3bR的细胞结合，C3b在抗原(靶细胞)和吞噬细胞或红细胞之间起到桥梁作用。这种免疫复合物粘附到细胞表面，形成较大复合物的现象称为免疫粘附。这种较大的聚合物，便于吞噬细胞的捕获和吞噬清除。 如果C3b使免疫复合物与吞噬细胞结合，则能促进吞噬细胞的吞噬作用，称之为补体的调理作用。这种调理作用对于全身性感染的细菌和
真菌，可能是主要的防御作用机制之一。