泥鳅种苗的繁殖容易，培育困难。目前，苗种培育的成活率一般为20%左右。要提高苗种培育的成活率，应注意科学方法。泥鳅孵化池应是一个20平方米以上的水泥池。出苗3天后，不急于分池培育。原有的池塘用于培育壮苗，并将其放入池塘中，期间投喂适量的蛋黄。在放苗之前，应该用生石灰或漂白粉彻底清洗池塘。一周后，水的毒性完全消失后，就可以放苗了。
放苗前，可将几条泥鳅苗放入水中进行试验，4-8小时内没有异常反应即可。放苗前亩放300公斤腐熟的粪便，培养天然饵料，3~5天后，池塘中浮游生物繁殖达到高峰，及时放苗。每亩投放泥鳅幼虫15万条左右，泥鳅苗入池后每亩用专用粉或自制粉喂养。不提倡喝豆浆。虽然豆浆适口性好，但不容易快速控制水质。在养殖泥鳅苗的初期，对水中的溶氧要求很高。一般来说，水中的溶解氧应达到每升4~5毫克。用喷头洒水增氧的效果较好，而且喷水小而密，不会伤害弱小的泥鳅苗。池塘水体透明度控制在30厘米以上，泥鳅苗1周后可单独养殖。经过一定时间的培育，不同池塘运输的熟练泥鳅水花苗达到一寸苗的大小。此时，鱼塘水质和底质会出现老化，缺乏浮游生物等天然饵料，难以准确估计鱼苗的数量和密度，也难以掌握饲料的用量。为了提高泥鳅的生长速度，应设计合理的养殖密度，以利于成鱼的饲养和管理，并抓好鱼苗的捕捞、收集和转移到池塘养殖。
泥鳅苗转入水质良好的鱼塘后，会有一个新的生长高峰。同时，在转塘过程中能有效清理大型害虫和野生鱼类。鱼苗捕捞前几天应检查鱼苗的健康状况，并进行消毒处理。捕鱼前至少要停止捕鱼一天。如采用网捕方式，应在网捕前2-3小时全池泼洒抗应激药物，如维生素C、多维、多糖等。同时，应准备好水笼或临时池塘，并保持水质清洁，溶氧量高，水温适宜。
为了尽量减少鱼苗的损伤，捕鱼时应选用密孔和柔软的材料。捕获的泥鳅苗应及时转入笼中进行水质处理，使其去除鳃中的泥沙、体内的排泄物和代谢粘液。泥鳅是一种底栖性鱼类。它很胆小，怕光。在捕捞和提水过程中，泥鳅会猛烈冲撞，产生强烈的应激反应，消耗大量体力和溶氧，严重时还会伤及鱼苗的嘴唇、上颚或尾部。因此，提水时应做好抗应激处理，注意增氧和换水。根据运输时间的长短，提水时间一般为2~10小时。提水后，要及时清除笼内死、残鱼、害虫和野鱼，并根据鱼苗的均匀度考虑是否需要进行筛选和分级。