细菌DNA的提取方法有哪些

提取少量的细菌DNA,有哪些方法?最好详细一点谢谢

第1个回答  2019-04-10
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快速微量提取法
A.取1.5ml
菌体
培养物
于一灭菌Ep管中,12000rpm离心1min,
丢去上清夜,收集菌体。
B.加入400ul裂解液(40mMTris-醋酸,20mM醋酸钠,1mMEDTA,1%SDS,pH7.8)混匀,置于37oC水浴1hr。
C.然后加入200ul5mol/L的
氯化钠溶液
,混匀后于13000rpm离心15min。
D.取
上清液
,用
苯酚
抽提2次,氯仿抽提1次。
E.加两倍
体积
无水乙醇
,1/10体积醋酸钾(3M
,pH8.0),-20度保存1小时后,13000rpm离心15min,弃上清液,沉淀用70%乙醇洗2次;置于室温干燥后,溶于50ulTE
溶液
中,置4oC保存备用。
2
蛋白酶/SDS法制备
先用10ml含适当
抗生素
的GBM过夜培养Delftia
sp.,第二天4000rpm离心10min收集菌体,用Washing
TE(50mmol/LTris-HCl
pH8.0,10mmol/LEDTA
pH8.0)洗菌体2次,之后将菌体充分悬浮在5ml

TE缓冲液
中,先后加入0.5ml
5mg/L的蛋白酶、0.5ml
10%
SDS,轻轻混匀后50℃放置3h~5h,接着用等体积的Tris饱和苯酚抽提2次,苯酚/氯仿/异戊醇抽提一次,氯仿抽提一次后,乙醇沉淀DNA,用自动移液器
吸管
头将絮状DNA沉淀块吸附到Ep管中,70%乙醇洗2次,干燥后溶于适当1×TE或ddH2O中。
3
1)
细菌培养:细菌接种于5ml
液体培养基
中,37℃摇床(300rpm)培养过液。
2)
细菌收集:取1ml培养物于1.5ml
EP管中,室温8000rpm离心5min,弃
上清
,沉淀重新悬浮于1ml
TE(pH8.0)中(用ddH2O也行)。
3)
菌体裂解:加入6μl
50mg/ml的
溶菌酶
,37℃作用2h。再加2mol/LNaCl50μl,10%SDS
110μl,20mg/ml的蛋白酶K
3μl,50℃作用3h或37℃过夜。(此时菌液应为透明粘稠液体)
4)
抽提:菌液均分到两个1.5ml
EP管,加等体积的酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1),混匀,室温放置5-10min。12000rpm离心10min。抽提两次。(上清很粘稠,吸取时应小心,最好枪头尖应剪去)
5)
沉淀:加0.6倍体积的异丙醇,混匀,室温放置10min。1
2000rpm离心10min。
6)洗涤:沉淀用75%的乙醇洗涤。
7)
抽(凉)干后,溶于50μl
ddH2O中,取2-5μl
电泳
。作PCR模板用。
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