我国目前秧田类型主要有水秧田、湿润（亦称半旱）秧田、肥床旱育秧田三种。不同育秧方式，因其水层管理的差异，杂草种类及发生规律亦不尽相同。
水秧田在育秧过程中，秧板经常保持水层。由于稗草及其他湿生杂草种子萌发需要足够的氧气，因此能有效地抑制杂草的发生。但水分充足，秧苗生长迅速，秧苗较嫩弱，扎根不牢，如播后遭遇低温，易倒秧、烂秧。水秧田仅在南方各省早春气温较高而比较稳定的稻区使用。由于此法不利于培育壮秧，面积在逐年减少。湿润秧田湿润秧田是我国使用面积较大、历史较长的育秧方式。在播种到出苗的这一段时间内，秧板不建水层，而采取沟灌渗水来维持秧板湿润状态，供应稻种发芽所需水分。直至一叶一心期，才建立稳定的薄水层，并适当的落干晒田。在这种湿润、薄水条件下，秧苗生长缓慢，但较为茁壮，有利于培育壮秧。但是，在湿润秧田中，杂草种类及数量均大大增加，尤其是稗草及湿生杂草的种子，在湿润无水层的条件下，较深层的种子也能获得所需氧气而萌发出土，不仅增加了杂草数量，而且由于萌发深度不一，发生期及高峰期亦有延长，秧板满水以后，虽然抑制了部分稗草及湿生杂草的萌发，而水生的双子叶杂草如节节菜、水苋等很快萌发，出现秧田第二次出草高峰。据上海崇明定点观察资料，稗草在水稻播后1～2天萌发，3～6天出土，始盛期为播后7天，高峰期为播后10天，随着秧苗生长而形成荫蔽及水层的抑制作用，20天以后即逐渐停止，而异型莎草则较稗草迟5天左右，节节菜则迟5～10天，在移植前仍在出草（表2）。
表2 湿润秧田杂草发生期及高峰期单位：播后天数上海崇明杂草种类 萌发 出土 始盛 高峰 盛末 停止稗 1～2 3～6 7 10 15 20～23异型莎草 1～3 4～7 10 10～15 20 32节节菜 1～6 7～10 10～15 15～20 25～30 32秧板满水后，由于水分供应充足，稗草生长加快，在秧苗3叶期时，稗草约2～3叶，3叶期以后即与秧苗同步增长，并逐步高出秧苗，移植时，稗草往往高出秧苗数厘米。
肥床旱育秧田：肥床旱育秧田是近十年来推广的省地、省水、省工的育秧方式，目前已普遍应用。操作过程为：整地时施足底肥（有机肥为主），苗床做好后浇足透水，播种，播量较湿润秧田为大。播后盖经筛的细土（或草木灰），然后盖膜。出苗后（播种后约8～10天）揭膜，以后正常管理。由于改变了秧床水层、温度、通气状况等生态条件，杂草发生的种类及出草规律均有了新的特点。
据调查资料，肥床旱育秧田的杂草种类显著增加，主要增加的种类为一年生湿生及中生杂草，如禾本科杂草除稗草外，尚有千金子、双穗雀稗等湿生杂草及马唐、狗尾草、牛筋草等中生杂草，莎草科杂草除异型莎草外，尚有碎米莎草、扁穗莎草、香附子等，双子叶杂草除节节菜、鳢肠、陌上菜外，尚有牛繁缕、婆婆纳、酸模叶蓼等（表3）。
表3 湿润秧田旱育秧田主要杂草种类地区 湿润秧田 肥床旱育秧田广西 稗、牛毛毡、异型莎草、碎米莎草、鳢肠、陌上菜 旱稗、千金子、马唐、稗草、牛筋草、双穗雀稗、香附子、野苋、畦畔莎草、旱苗蓼、石胡荽
表3 湿润秧田旱育秧田主要杂草种类（续）-1地区 湿润秧田 肥床旱育秧田江苏沿江 稗、陌上菜、鳢肠、丁香蓼、水苋菜、节节菜 空心莲子草、刺果毛茛、节节菜、陌上菜、婆婆纳、鳢肠、一年蓬、繁缕、藜、香附子、扁穗莎草、异型莎草、稗、千金子、双穗雀稗、马唐、狗尾草肥床旱育秧田的杂草种类、草相及群落构成，地区之间甚至田块之间差异均较大。首先与床址的选择有关，不同床址土壤杂草种子库的构成亦不同，如床址前茬为水稻（稻—麦连作），杂草种类则比较单纯，大都为湿生杂草，各田块差异亦不大，如床址选择在旱茬地或菜园地则杂草种类多、群落构成复杂、田块之间差异较大。其次，盖籽细土来自沟、渠、埂边或旱田，则杂草种类多、数量大，且常使一些多年生杂草的地下茎段如双穗雀稗、假稻、半边莲等带入苗床，致使草相更为复杂，如土源来自本田母土，则杂草种类变化不大。另外，有机肥的来源及腐熟程度对杂草种类及数量也有影响，因此，秋冬季节即开始培土做好的苗床，由于底肥腐熟程度较高，杂草种类及数量均较少，而随做苗床随播种则杂草种类及数量均较多。
肥床旱育秧田杂草种类虽有增加，但仍以水稻伴生杂草稗、异型莎草及湿生双子叶杂草鳢肠等为优势种（表4），特别是稗草可随水稻移植带入本田，为害较大。其余杂草种类虽多，但随着揭膜以后苗床的高湿管理，秧苗密度高且生长快，从而受到抑制，稗草及其他稻田主要杂草仍是肥床旱育秧田防除的重点。
表4 肥床旱育秧田杂草草相**江苏高邮十二个乡镇归总资料杂草种类 优势种（频度90%～100%）常见种（频度25%～90%）少见种（频度25%以下）稗 鳢肠 异型莎草 空心莲子草 旱苗蓼 马唐 牛筋草 牛毛草 节节菜 藜 碎米荠 陌上菜 狗尾草 苘麻 矮慈姑 马齿苋 千金子 狗牙根频度% 100 100 91.7 91.7 91.7 75 58.3 50 33.3 35.3 25.0 25.0 25.0 16.7 8.3 8.3 8.3 8.3由于肥床旱育秧田高温高湿的生态环境，与湿润秧田相比，杂草发生量大，出草集中、高峰期提前，据定点观察，覆膜后2～3天即可见草，5～7天至揭膜时为出草高峰，高峰期所出杂草约占秧田期出草量的90%，揭膜后仍可出草，但出草数量较少，杂草的发生仍以禾本科杂草首先出土，其次为莎草科杂草，然后为双子叶杂草。