（1）秧田杂草
秧田杂草种类很多，但为害较大的主要是稗草、莎草科杂草以及野慈菇、雨久花、眼子菜等水生阔叶杂草。一般又以稗草的为害最为普遍、严重。稗草与水稻很难分清，不易人工剔除，常常作为“夹心稗”移入本田。在秧田为害较为普遍的另一类杂草是莎草科杂草，如扁秆藨草、三棱藨草等，其块茎、地下匍匐枝发芽生长极快，不仅严重影响秧苗的生长，而且影响移栽时的起秧速度和质量。水稻秧田的化学除草方法主要有：
丁·扑（丁草胺与扑草净混剂）旱育秧播种覆土后苗前封闭。这一措施在水稻秧田覆盖薄膜前进行，使用简便，除草谱较广，能够防除各类禾本科和绝大多数阔叶杂草，但播种后必须覆盖0.5厘米～1厘米厚的细土，费力费工，尤其是对水稻不安全，容易抑制水稻发芽和生长。
杀草丹苗前水封闭。在水稻播种前，灌水淹没秧床，每667平方米（每亩）用90%杀草丹乳油130毫
升～190毫升甩施于水中，保水48小时以上。这一措施使用简便，能防除包括双稃草在内的各类禾本科杂草，且成本较低，目前只在部分沿海水育秧田应用。
灭草松苗后落干喷雾。每667平方米（每亩）用25%灭草松水剂300毫升～400毫升，这一措施十分安全，但成本较高，能除治绝大多数阔叶杂草和扁秆藨草等莎草，常与敌稗或二氯喹啉酸混用。
五氟磺草胺苗后喷施或撒施。每667平方米（每亩）用2.5%五氟磺草胺乳油40毫升～120毫升喷雾或拌肥撒施。这一措施除草谱广，能够防除各龄期大多数禾本科和各类阔叶杂草，也能除治扁秆藨草等莎草，对某些禾本科杂草如双稃草、马唐和牛筋草除治效果差。可喷施也可拌肥撒施，喷施时可落干也可带水层，较为方便，成本适中，近几年推广较快，应用最为普遍，成为首选药剂。
（2）移栽稻田
移栽田的稻根入土有一定深度，抗药性强。但其生育时期较秧田长，气温适宜，杂草种类也较多，且交替发生。因此，施用药剂的种类和适期也不同。以种子繁殖的一年生杂草因水层隔，在1厘米以内表土层中的种子才能获得足够的氧气而萌发。一般这类杂草在水稻移栽后3天～5天萌发（稗草先萌发），1周～2周内达到萌发高峰期。而以根茎繁殖的多年生杂草，由于根茎分布较深，有的可达10厘米以上，因此，出土高峰多在移栽后的2周～3周。
根据各种移栽稻田杂草的发生特点，化学防除策略是狠抓前期，控制中、后期。通常是在移栽前或移栽后的初期采取毒土处理，以及在移栽中、后期采取毒土处理或喷雾处理。前期（移栽前至移栽后10天）以防治稗草及1年生阔叶杂草和莎草科杂草为主。中、后期（移栽后10天～25天）则以防治扁秆藨草、眼子菜等多年生莎草科杂草和阔叶杂草为主。具体施药时期和方式分为移栽前封闭、移栽后前期毒土处理和移栽后中期毒土或喷雾处理3个时期。
在水稻本田施用的除草剂，除要求必须撒干水层直接喷洒到茎叶上的几种除草剂外，其他的除草剂都应在保水的条件下进行，且应保持水层5天～7天，缺水时应补灌至适当深度。
移栽田主要化学防除技术包括：
每667平方米（每亩）60%丁草胺乳油100毫升，插秧3天前水封闭或插秧5天后毒土（肥）法施用。主要除治稗草等禾本科杂草，对部分阔叶杂草也有效，该药药效受温度影响小，对水稻较为安全，成本低，在各类稻田多年来均一直广为应用。
每667平方米（每亩）10%苄嘧磺隆可湿性粉剂25克或每667平方米（每亩）10%吡嘧磺隆可湿性粉剂15克～20克，插秧前或插秧后用喷雾器摘掉喷杆喷施、毒土或毒肥法均可。主要除治各种莎草和各种阔叶水生杂草，成本低，在水生阔叶杂草和莎草发生田，多年来一直与丁草胺配合广泛使用。两者药效均受温度影响较大，插秧后
用药效果好。
每667平方米（每亩）25%西草净可湿性粉剂100克～150克，插秧7天前水封闭，或分蘖末期毒土法施用。主要除治各种阔叶杂草和水绵，成本低，在保水较好、水绵发生较重稻田，多年来一直与丁草胺配合广泛使用。但其安全性较差，在水稻插秧后的缓秧和分蘖期不宜施用。
每667平方米（每亩）45%三苯基乙酸锡可湿性粉剂40克～45克，见水绵后用喷雾器摘掉喷杆喷施或毒土法均可。专门用于除治水绵，对水稻安全，可在水稻插秧后的缓秧和分蘖期施用，但成本较高。近些年来，稻田水绵发生加重，该药用量加大。