可能性不大
在留资格证是办理赴日签证一个很重要的参考，目的是检验你去日本是否有正当的理由和目的。办在留的时候也会经过考核，通过了之后才能拥有在留资格。所以，一般有在留资格证再去办理签证，只要不是因为太离谱的愿意，就不会被拒签。
正常情况下，日本留学签证的更新过程是比较简单的。首先需要注意的是在你的留学签证到期前的一一个月，就要向有关的机构提交留学签证更新的申请书，然后带着你所准备的材料去办理更新手续，然后等待审核通过就可以了。
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