有枸杞实蝇、枸杞刺皮瘿螨、蚜虫、负泥虫等。
（1）枸杞实蝇 属双翅目实蝇科害虫，是枸杞主要害虫之一，每年因实蝇为害损失枸杞子22%～50%，严重时达80%。6月下旬至7月上旬是为害盛期。幼虫取食果肉，果肉吃完，布满虫粪，被害果成熟时变色、萎缩、干枯，不能药用。老熟幼虫在夜间于近果柄处钻孔外出，弹跳入土，在土下3～8厘米处化蛹，一年发生3代，以蛹在土内越冬，翌年羽化。
防治方法：越冬成虫羽化时（4月下旬至5月初），结合枸杞园的翻耕，在枸杞园树冠下及枸杞园周围较高处撒施5%西维因粉剂每亩3千克或90%晶体敌百虫75～100克（15～20千克细土混合拌匀），然后浅耙，并以表土覆盖；摘除蛆果，并深埋处理或烧毁；秋、冬季园内灌水或翻土，杀灭土内越冬蛹。
（2）枸杞负泥虫 又名金花虫、肉蛋虫，是枸杞、颠茄、泡囊草等药用植物的重要害虫，成虫产卵于嫩叶上，卵块呈人字形排列。以成虫和幼虫咬食叶片，使叶片残缺不全形成缺刻或穿孔，严重时仅留叶脉。在4～9月均可为害。
防治方法：幼龄期喷90%的敌百虫800～1000倍液或40%乐果乳液1000～1500倍液喷雾，7～10天1次，连喷2～3次；不与茄科植物间套作；摘除带虫果实或枝条，集中烧毁或深埋。
（3）枸杞蚜虫 枸杞蚜虫刺吸嫩芽、叶片、幼果汁液，使植株呈褐色枯萎，造成树势衰弱，生长停滞，早期落叶。
防治方法：加强中耕除草，秋、冬清除田埂、路边野生杂草，以减少蚜虫越冬寄主；用40%乐果乳液1000～1500倍液喷雾防治。
（4）枸杞刺皮瘿螨又称锈螨或锈壁虱，也是枸杞四大害虫之一，为害枸杞幼果、果柄、嫩茎和叶片，可产生紫红色痣状虫瘿，使组织畸形。在枸杞园产生为害时，虫体密布叶片吸食汁液，使被害叶片表皮细胞坏死，叶片增厚、变脆，叶面变成铁锈色，提前脱落，变成秃枝，枸杞园一片枯褐色。对产量品质影响很大，一般减产60%左右。一般4月上、中旬产卵，6～7月和9月为该害虫的两个为害高峰期。
防治方法：冬季清园，将枯枝落叶集中烧毁；加强枸杞园管理，合理修枝整形，增加通风透光，降低湿度；合理施肥，增施农家肥，肥料配比合理，增强枸杞植株的耐螨性；春季展叶期和秋梢抽放期用40%乐果乳油1000倍液，或5%尼索朗可湿性乳油1500～2000倍液，或73%克螨特乳油2000～3000倍液，或45%～50%硫磺胶悬液喷雾2～3次，以上药剂都有较好的防治效果。