在这种基层遇到困难、急需支援的特殊情况下，作为机关人员是应该积极奔赴一线的。你如果坚决不去一线，这不简单是旷工问题，而是职业精神问题。单位当然不会开除你，但是在领导和同事心目中，你可能会被打入冷宫。很简单的逻辑，你不“热爱企业”，企业凭什么要“热爱”你？
这个问题要从四个层面来看待：
第一，从法律层面来看。
你是部门人员，不是车间人员，你的劳动合同中已经写明了你的岗位职责，那么，你拒绝调整工作职责，是你的合法权益，你的拒绝也是合情合法的。公司不能以你拒绝其他不相关工作而判定你旷工。
旷工的定义，不经单位批准而不到岗（不履行岗位职责），即：无故不到岗。如果你当天在部门岗位上做事，没有去车间帮助工作，单位不能判定你旷工，因为你正在岗位上履行你的本职工作，怎么能算旷工呢？
如果单位真的这么处罚你，只要你仲裁、申诉，百分百是能打赢的官司的。当然，如果这家公司对你还不错，薪酬福利还不错，不建议为这点事情去打官司。再说，于情于理，你也有一些站不住脚的地方，赢了“官司”，输了“人品”。下面详述。
第二，从企业层面来看。
企业对员工的职责定位，除了岗位职责之外，都会另外两句话：完成领导交办的其他任务，在应急情况下无条件服从必要的单位安排。这两句话，一般情况下，不会指常态工作，而是特殊、临时、突发情况。
比如，在车间忙不过的情况下，在车间突然遭遇暴雨的情况下，在车间发生火灾的情况下，单位有权调动岗位人员参与应急工作的，这是企业的合法权益。当然了，这里面也有法律的界定，比如，单位不能调度机关人员（不具备抢险能力和资质）去灭火吧。
前不久，有一个新闻，南京某企业突然接到海外大订单，需要突击生产出来，企业要求员工加班，有两名员工拒绝加班被企业处罚。这两位员工申诉，结果败诉。企业在特殊情况下，有权要求员工加班，员工是不能无理拒绝的。这也是企业的合法权益！如果员工都不加班，订单没法完成，企业破产，劳动法也不支持这种做法的。
所以，车间遇到临时、突发、紧急的任务，企业有权调度机关人员到车间帮助工作的。其实，这种临时做法，很多企业都普遍存在，尤其是体系内的单位，比如，搞创城活动，所有机关人员去扫大街；比如，暴雪过后，机关人员去除雪，等等。
劳动法是双方保护的，既保护劳动者，也保护企业。正如题主的描述，车间招不到人，企业要求其他人员从事与本职工作不相干的任务，如果确因公司大局利益需要，劳动法也支持企业的自主行为，虽然定义为旷工不合法，但企业的要求是合法的。
第三，从职业精神层面来看。
无论是什么单位，都要讲究“职业精神”，这是职场的底层逻辑。职业精神的核心要素之一，就是要顾全企业的整体利益。古语：皮之不存毛将焉附？企业破产，员工也没有好处。员工服从、服务于本职工作要求，也要服从、服务于企业的整体利益要求。
车间招不到人，暂且不论这是什么原因、这是谁的责任，单论此时此刻的企业利益何在？企业的大局利益，此时此刻在于把车间运转起来，企业内部的人都应该服从、服务于这个大局利益。别说，像题主这样的其他人员，就算是总经理、副总经理也要亲自带头去车间干活。
举一个更形象的例子：如果车间跑水里了，领导一声令下，所有的人都应该跑步进车间排水，难道还分你的职责还是我的职责吗？这是职业精神的核心意义所在。
车间招不到人，机器不能停，产品要供货，难道机关人员不能进车间干活吗？再说了，很多机关人员本身就是从车间里成长起来的，车间的技术活，他们都会干，临时顶岗一下是可以的。前提是，机关人员具备上岗资格，没有上岗资格，是不能操纵机器的。这里脑补一下镜头，估计是让机关人员帮忙搬运货物而已。
第四，从员工层面来看。
车间招不到人，这是什么原因？大概率是三个方面原因：第一，薪酬福利太低，远低于市场价格，没人来应聘；第二，留不住人，岗位员工每天都在流失，所以，每天都在招工，但挡不住流失的速度；第三，客观原因，这个行业不景气，这个地区没人来，招工难，并不是这家企业的个例，而是整个就业市场的普遍问题。
实事求是地讲，不能完全埋怨企业，这个实体经济的下滑，生活成本的上升，尤其是吸纳大量就业人员的制造业不景气，导致了用工荒。工资低，生活成本工，打工者宁愿摆地摊也不进工厂。如果提高工资，工厂立即亏损，因为毛利率太低了。这个“矛盾”，是一个结构化的就业市场的底层问题，暂且不分析。
如果车间招不到人，只是一时一地的困境，机关人员临时去车间帮忙工作，这是有情可原的，作为员工，还是要服从服务企业整体利益的。但是，如果不能解决招工难的问题，经常让机关人员去车间干活，这就违背了劳动法，严重偏离了员工的本职要求，侵犯了机关人员的合法利益。
如果车间经常招不到人，说明企业的薪酬福利太低，企业的发展前景堪忧。如果企业经常让机关部门的人员去车间里当工人，实际上是增加了部门人员的工作量，因为去车间里干活，所在部门的本职工作量并没有减少，还要加班加点弥补回来。如果企业不给加班费，还要处罚不去车间的员工，于情于理都是站不住脚的。这样的企业，要做好辞职准备。