根据上述职责，省国土资源厅设19个内设机构：
(一)办公室。
组织协调厅机关日常运转工作；负责重要会议的组织、文电处理、秘书事务、新闻发布、机要、档案、保密、接待、机关财务、综合治理、信息化建设、政务公开和国土资源综合统计等工作；综合协调电子政务、宣传等工作。
(二)政策法规处。
组织起草、修改国土资源管理法规、规章草案；承担厅机关有关规范性文件的合法性审核工作，组织协调国土资源系统普法宣传教育；推进国土资源系统依法行政，承担行政复议、征地补偿安置争议裁决和行政应诉的有关工作。
(三)综合研究处。
组织国土资源管理重大课题调研；承担有关重要文稿的起草工作；开展全省国土资源经济形势分析，提出规范国土资源管理的政策建议，参与宏观经济运行及相关改革研究；负责国土资源重要信息综合和政务信息的收集、报送工作；组织对全省国土资源领域重大问题、重要决策等进行研究论证。
(四)规划处。
编制实施全省国土、土地利用总体规划；组织编制矿产资源开发利用、测绘管理、地质环境、资源调查评价、勘查、开发、整理、复垦等专项规划；依法指导和审核国土资源相关规划；编制管理土地利用计划和国土资源调查评价计划；承担建设项目用地预审工作。
(五)财务处。
承担国土资源有偿使用管理工作，拟订收益分配制度和使用政策，参与国土资源资源性资产管理和国家出资形成的矿业权权益管理；参与国有土地使用权、探矿权和采矿权价款评估结果审核；拟订部门财务和资产管理规章制度；依法承担国土资源规费征收管理；负责编制部门预决算；负责部门国有资产管理；负责内部审计工作。
(六)耕地保护处(省农业区划委员会办公室)。
承担基本农田保护和土地整理、复垦、开发管理工作；承担耕地保护责任目标考核的有关工作，监督检查基本农田保护和占用耕地补偿制度落实情况；承办省农业区划委员会交办事项。
(七)建设用地处。
拟订农地转用管理办法；承办需报国务院、省人民政府批准的各类建设项目农用地转用和土地征收的审核、报批工作；参与建设用地的前期论证工作，组织建设用地会审工作；组织发布各类建设用地信息；统一管理全省征地拆迁补偿安置相关工作，协调大中型建设项目的征地工作。
(八)地籍管理处。
拟订和实施地籍管理办法；拟订土地确权、登记、发证、争议调处办法并监督指导工作，调处重大土地权属纠纷；承担各类土地登记资料的整理、共享和汇交管理，提供社会查询服务；拟订土地调查、监测、统计的相关规定和全省土地调查、监测方案并组织实施；指导地籍信息系统的建立与维护。
(九)地产管理处。
承担土地利用评价和管理，检查各类建设用地利用实施情况；负责土地市场管理；拟订并组织实施土地供应、土地价格、土地资产、土地交易和土地储备管理政策，负责宗地供应主要资料的审查备案工作；拟订并实施土地开发利用标准；承担节约集约用地评价和农村集体建设用地使用权流转管理；组织实施基准地价、标定地价等地价制度，对土地市场和地价实施动态监测。
(十)矿产开发管理处。
编制矿产资源保护和开发利用规划并监督实施；组织拟订并监督实施全省采矿权年度出让计划；依法进行采矿权审核登记发证和采矿权转让审核登记；组织划定省级规划矿区，编制实施采矿权设置方案；承担矿产资源保护和保护性开采特定矿种的管理事项，下达开采总量控制指标；参与采矿权市场的监督和管理；对矿产资源开发利用活动进行监督管理；调处重大采矿权权属纠纷。
(十一)地质勘查处。
编制全省地质勘查规划并监督检查执行情况；贯彻执行地质勘查工作标准、规程、规范；依法实施地质勘查行业管理，审批地质勘查资质；编制实施探矿权设置方案，依法进行探矿权
审核登记发证和探矿权转让审核登记工作；监督管理地质勘查活动和探矿权市场；依法调处探矿权权属纠纷；监督地方地质勘查项目和重大地质勘查专项实施；指导、协调、监管全省地质调查和矿产资源调查评价。
(十二)矿产资源储量处。
拟订矿产储量管理办法、标准、规程、规范；管理矿产资源储量的评审、登记和统计工作；负责全省矿业权评估管理；实施矿山储量动态监督管理；承担矿产地储备管理工作、压覆矿产资源管理事项；负责地质资料汇交管理工作；组织矿产资源形势分析和战略研究。
(十三)地质环境处。
拟订和实施地质资源、地质灾害管理办法；编制和监督实施地质灾害防治和地质遗迹保护规划；监管矿山地质环境；依法管理水文地质、工程地质、环境地质勘查评价工作；组织、协调、指导和监督地质灾害防治；指导地质灾害和地下水动态监测、评价和预报；负责地热水、矿泉水的相关管理工作；对具有重要价值的地质遗迹保护区提出认定意见；审批地质灾害危险性评估、地质灾害治理工程勘查、设计、施工监理单位资质。
(十四)基础测绘处。
编制省级基础测绘发展规划和年度计划；组织实施基础测绘、行政区域界线测绘和其他重大测绘项目；建立和管理全省基础地理信息系统，建立和维护测绘基准体系；负责基础地理信息数据、成果的管理、分发和服务；负责相对独立的平面坐标系统审批；负责测绘航空摄影及遥感获取管理；负责测绘成果的保密管理；负责审定全省的测绘技术标准、规程和规范；依法审查对外提供属于国家秘密的测绘成果。
(十五)测绘行业管理处。
审核测绘单位资质；核发测绘人员作业证件，负责注册测绘师资格和测绘仪器检定人员资格工作；按国家规定审核外国组织、个人来湘测绘；负责全省测绘成果和地理信息数据质量的监督管理；负责永久性测量标志的管理；规范和监管全省测绘市场；管理地图的编制、印刷、出版、展示和登载工作。
(十六)科技与对外合作处。
组织编制实施全省国土资源科技发展和国土资源对外合作战略、规划及年度计划；承担国土资源科技项目、科技成果的管理和科技人才培养；负责全省国土资源系统科普普及推广等相关管理工作；组织制定全省国土资源技术标准、规程和规范；组织协调境外矿产资源勘查和参与开发等相关工作；负责国土资源招商引资项目的组织协调工作；承担省政府授权的有关国土资源对外合作与交流事项。
(十七)直属土地管理处(对外称直属土地管理局)。
负责省直机关和中央在湘单位、省属企业事业单位使用的土地资产管理；负责管辖范围的初始登记备案、土地变更登记和其他权利登记；负责铁路、高速公路国有土地的管理；承办管辖范围的土地使用权出让、收回、转让等审批手续；协助做好管辖单位土地收益的征收；负责省属和中央在湘单位矿业权资产管理。
(十八)人事处。
承办厅机关、直属单位的机构编制和人事管理等工作；承办市州国土资源主管部门领导干部双重管理的有关具体工作；承担国土资源人才规划编制，组织实施教育培训工作。
(十九)信访处。
承办国土资源部和省政府交办的国土资源信访事项；协调、处理重要国土资源信访事项；督促检查转办、转送和交办的国土资源信访事项处理情况；开展信访调查研究。
离退休人员管理服务处。负责厅机关离退休人员管理、服务工作，指导直属单位的离退休人员管理、服务工作。
机关党委。负责厅机关和直属单位的党群工作。
纪检(监察)机构按有关规定设置。
