病原微生物只有11个分类，分别是：
1、细菌：属于原核细胞型微生物，具有细胞壁细胞膜，细胞浆和原始核，但无核膜和核仁，缺乏细胞器，其繁殖是简单无性二分裂法；可引起各种化脓性感染及伤寒、痢疾、百日咳等传染性疾病；用普通光学显微镜可见，可被高温、干燥、紫外线、多种化学毒剂和抗菌素杀灭或抑制。
2、病毒：是非细胞型微生物，体积微小，能通过滤菌器，一般在光学显微镜下不可见，主要由核酸和包在核酸外的蛋白质壳组成，以复制形式增殖，只能在活细胞内生长增殖，可以引起麻疹、流感、小儿麻痹症、脑炎等病疾；绝大多数病毒对磺胺及抗生素不敏感。
3、立克次氏体：是介于细菌与病毒之间的微生物，有相似细菌的形态结构和繁殖方式，虽义寄生在各种节肢动物体内（恙虫、虱、蚤），并通过这些节肢动物为媒介进行传播，能引起斑疹伤寒、恙虫病等疾病；必须在活细胞内寄生，繁殖方式为二分裂，对一些抗生素如氯霉素、四环素敏感，对磺胺不敏感。
4、螺旋体：是食亍细菌与原虫之间的一类微生物，体形细长、弯曲，呈螺旋状，具有细菌所有的基本结构，二分裂繁殖，可引起梅毒、回归热及钩端螺旋体等病。
5、真菌：为真核细胞型微生物，细胆餐分化程度较高，有核膜、核‘仁和染色体，具有完整的细胞器，以出芽形成菌丝，产生孢子：及菌丝分枝断裂等方式繁殖，可引起各种皮肤癣、白色念珠菌病等。
6、革兰阳性球菌： 金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌。肺炎链球菌可引起免疫缺陷者、老年人、婴幼儿败血症。B群链球菌常可引起新生儿败血症。炭疽芽胞杆菌（肺型、肠型、皮肤型）均可引发败血症。
7、革兰阴性杆菌： 常见的细菌有大肠杆菌、肺炎克雷伯菌、假单胞菌（主要是铜绿假单胞菌）、变形杆菌、产单核细胞李氏菌、沙门菌属、坂畸肠杆菌、空肠弯曲菌、鼠疫耶氏菌。
8、厌氧菌：无芽胞厌氧菌（脆弱类杆菌），产气荚膜梭菌。
9、非细胞生物：主要包括病毒和朊粒等。病毒无细胞结构,仅由蛋白质外衣包裹核酸构成,如甲型肝炎病毒、SARS冠状病毒等。朊粒是一种感染性蛋白质分子,能够引起动物和人类脑组织慢性海绵体变性,如疯牛病及...
10、原核细胞型生物：由裸露的DNA盘绕形成原始核质,没有核膜和细胞器,包括细菌、立克次体、衣原体、支原体、螺旋体,属于广义的细菌范畴。
11、真核细胞型生物：包括真菌、原虫等。
病毒性质分析
病毒它是没有细胞结构的，但是它比细菌还小，它是有遗传有这种复制能力的这样一种微生物。所以说它的这种产生和它的致病性。
它的这种特点，比如这几年出现的一些病毒性肝炎，像各种病毒的这样一些感染它最大的一个特点就是它的这种变异性很快，所以对于病毒性的这种特别，在发明这种疫苗生产比较难，跟这个是有关系的。
寄生虫：血吸虫，弓形虫，巴贝斯虫，泰勒虫，利什曼原虫，疟原虫……
病毒：流感病毒，甲肝病毒，乙肝病毒，丙肝病毒，丁肝病毒，狂犬病毒，日本脑炎病毒，埃博拉病毒，SARS冠状病毒，新型布尼亚病毒，艾滋病毒（HIV）……