66问答网
所有问题
当前搜索:
如何分析转录组测序结果
RNA-seq摸索:3.基因表达水平
分析
→featureCounts计量→差异表达分析及可...
答:
raw count 作为原始的read计数矩阵是一个绝对值,而绝对值的特点是规模不同(基因长度、
测序
深度),不可以比较。进行这些基因标准化方法的目的是将count矩阵转变为相对值,去除技术偏差的影响,使后续的差异
分析
具有统计学的意义。limma/voom,edgeR,DESeq2,
转录组
差异分析的三大R包!
测序
相关知识总结
答:
高通量
测序
技术(High-throughput sequencing,HTS)是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变,一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing,NGS )足见其划时代的改变, 同时高通量测序使得对一个物种的
转录组
和基因组进行细致全貌的
分析
成为...
转录组测序
是什么意思?
答:
包括对比不同组织或条件下RNA表达的差异
分析
、Gene Ontology富集分析等等。
转录组测序
技术作为生物医学研究和临床诊断的重要工具,已经广泛应用于肿瘤学、神经学、生殖生物学、心血管疾病等多个领域。它的机遇和挑战并存,未来需要不断完善技术细节、优化数据分析方法,推进数据管理互联互通等方面的发展。
转录组测序
流程步骤是哪些?
答:
以真核
转录组测序
为例,实验流程为总RNA提取-mRNA分离-建库试剂-定量-文库回收-桥式扩增-上机测序;项目
分析
流程为数据产出数据=数据去杂-转录组拼接-SSR分析及SNP分析-基因功能注释-基因表达差异分析-差异基因表达模式聚类-差异基因富集分析。
转录组
是什么,
测序
是什么,有什么用?
答:
转录组
分析
指对细胞内所有转录产物的集合的分析。转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。
转录组测序
一般是对用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)进行亲和纯化的RNA聚合酶II转录生成的成熟mRNA和ncRNA进行高...
在
转录组测序分析
中,对于没有参考基因组信息的序列
怎样
进行注释,差异...
答:
转录
本是一个基因序列通过一种剪切后所得的能RNA。以前说转录本都是说表达蛋白的。现在LncRNA的研究多了,也说是一个转录本了。还有没有参考基因组序列的,一般是不可能去GO功能注释的。因为去功能注释的时候要有一个背景。
转录组测序
是什么意思
答:
包括对比不同组织或条件下RNA表达的差异
分析
、Gene Ontology富集分析等等。
转录组测序
技术作为生物医学研究和临床诊断的重要工具,已经广泛应用于肿瘤学、神经学、生殖生物学、心血管疾病等多个领域。它的机遇和挑战并存,未来需要不断完善技术细节、优化数据分析方法,推进数据管理互联互通等方面的发展。
单细胞
转录组测序
知识一隅
答:
想了解更多单细胞相关知识,点击查看: 1.单细胞
转录组
(Single cell RNA)概述 2.单细胞转录组亚群
分析
3.单细胞转录组高级分析介绍 4.单细胞RNA系列专题之一:单细胞RNA
测序
中质控之重要细节 (上篇) 5.单细胞RNA系列专题之一:单细胞RNA测序中质控之重要细节 (下篇)10xGenomics单细...
转录组结果
和qRT-PCR结果又不一致?!
答:
转录组测序
(RNA-seq)将细胞内某一类型(或全部)的RNA逆转录成DNA,通过高通量测序的方法测定其序列并统计其表达水平的一项技术。是检测基因表达变化的通用方法。qRT-PCR 是指通过对 PCR 扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测从而实现对起始模板定量及定性的
分析
。RNA-seq无需知道实验样本的基因...
怎么
知道
测序
数据是
转录组
还是基因
答:
怎么
知道
测序
数据是
转录组
还是基因 转录组学的研究对象包括mRNA和非编码RNA等。新一代高通量测序技术可以全面快速地获得特定细胞或组织在某一个状态下几乎所有转录本的序列信息和表达信息,从而准确地
分析
基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学的重要问题。基因表达谱测序是直接对某...
棣栭〉
<涓婁竴椤
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
涓嬩竴椤
灏鹃〉
其他人还搜