只要体现在职能不同，归属不同。国土资源局一般属于直统单位，不归地方管理，规划局、建设局一般归地方管辖。但是三者在实际工作中的联系比较多。.
三者主要工作职能如下：
1、规划局：负责城乡规划管理工作，开展城市总体发展战略规划的研究和组织编制。参与制定区域性发展规划、某地区经济和社会发展规划、主体功能区规划和土地利用总体规划。
2、建设局（就是住建局）：综合管理全市建筑活动，规范建筑市场。指导和监督建筑市场准入、工程招标投标、工程监理、工程质量与安全，拟定勘察设计、施工、建设监理和相关社会中介组织管理法规实施办法并监督实施。
3、国土局：主要责任是保护和合理利用土地、海洋、矿产资源。例如保护耕地和基本农田，开发土地，审批建设用地和农村私人建房，办理土地出让、转让、出租、抵押，调处土地权属纠纷等。
扩展资料：
在很多二、三线城市或大城市的行政区内，由于在基本建设程序中规划局和建设局工作关联度高，且建设任务不太多的情况下，为节约人力资源、缩短办事流程、减少政府系统内部推诿扯皮现象，建设局和规划局都已合并，简称“规建局”。
参考资料：
规划局、建设局和国土局之间三位一体，规划局立项建设局报审国土局盖章。
1、市规划局是主管城市规划工作的市政府工作部门。贯彻执行国家、省有关城乡规划的方针政策、法律法规及技术规范、规程、标准，负责拟订全市有关城乡规划的规范性文件和政策，并组织实施和监督检查；负责全市建设项目的规划选址、建设用地和建设工程的规划管理工作等等。
2、建设局管理规划区内城镇土地的使用、出让和转让以及房地产开发工作；负责全旗城市总体规划、村镇规划、专项规划、分区规划、详细规划审查、报批和组织实施工作；按照干部管理权限，管理局机关和直属企事业单位的干部、人事和劳资工作；在旗职改领导小组的领导下，负责旗系统专业技术职务评审报批及年度考核工作等等。
3、国土局负责规范国土资源权属管理。依法保护土地资源、矿产资源、海洋资源等自然资源所有者和使用者的合法权益，组织承办和调处重大权属纠纷，指导土地确权，承担各类土地登记资料的收集、整理、共享和汇交管理，提供社会查询服务；承担全国耕地保护的责任，确保规划确定的耕地保有量和基本农田面积不减少。牵头拟订并实施耕地保护政策，组织实施基本农田保护，监督占用耕地补偿制度执行情况。指导未利用土地开发、土地整理、土地复垦和耕地开发的监督工作。组织实施土地用途管制、农用地转用和土地征收征用，承担报国务院审批的各类用地的审核、报批工作等等。
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