概括的说就是C是控制台应用程序，就是运行时出现一个就像dos黑色窗口，而widows程序设计是窗口应用程序，就像WORD，记事本等这样的有窗口框架的程序设计。还有就是他们的编程思想不同，C语言是面向过程的，可以理解为顺序的执行；而Widows是面向过程的，事件触发，模块化的编程思想，如果学过VB的话就很容易理解。另外C的程序入口函数是main，windows程序的入口函数是Winmain，windows定义了很多句柄和宏定义，刚开始理解起来有些困难，比如int WINAPI WinMain (HINSTANCE hThisInstance, HINSTANCE hPrevInstance, LPSTR lpszArgument, int nFunsterStil) ，各个参数的解释请看
http://baike.baidu.com/view/1002349.htm讲的很清楚。学过C的人刚开始学VC的时候思想有些转不过来，慢慢就好了，还有
http://xpshell.blogchina.com/xpshell/2581788.html这个是别人写的windows编程机制，我看这不错，希望对你有点帮助。