保险公司结案不需要先经过车主同意。
保险公司结案具体流程：
1、如果双方达成了民事赔偿协议，那就可以去交警那里结案了。
2、去交警那里结案是要双方都去的，把双方的协议内容报告交警，交警要把内容记录在事故处理报告书中的，然后双方签字就完成了。
3、到保险公司办理保险理赔，是要交警的事故责任认定书和事故处理报告书的，其中关于民事赔偿的调解的内容也在里边了。再加上手里的费用单据和收条，车辆行驶证和司机的驾驶证复印件，即可到保险公司办理索赔了。
事故结案时没有很严格的时间限制的，一般对赔偿追诉期为两年。关键是以伤员治疗和赔偿调解协商成功为条件的，有时也有双方均达不成协议，以协商不成结案的。