日本机票的便宜预订网站有：Skyscanner、Kayak、Expedia、Traveloka等。
解释：
1. Skyscanner天巡网：Skyscanner是一个全球性的机票预订网站，界面友好且操作简便。它不仅提供机票预订服务，还可以比较不同航空公司和不同时间段的机票价格，帮助用户找到最优惠的机票。
2. Kayak旅游搜索引擎：Kayak也是一个集多种航班选择为一体的搜索引擎，它能自动比较各大航空公司和旅行网站的机票价格，帮助用户找到最便宜的机票。用户还可以在Kayak上设置价格警报，当机票价格达到用户设定的价格时，系统会发送通知提醒用户购买。
3. Expedia订机票网站：Expedia是全球最大的在线旅游公司之一，提供全球范围内的机票预订服务。在Expedia上预订机票可以享受优惠价格，同时它还提供丰富的旅游套餐和酒店预订服务。
4. Traveloka旅游预订平台：Traveloka是东南亚地区知名的在线旅游平台，提供包括日本在内的全球各大目的地的机票预订服务。其平台上常有优惠活动和折扣券，可以帮助用户节省机票费用。
以上这些网站都是预订日本机票时可以考虑的优质选择。不同的网站可能会有不同的优惠和折扣，建议用户在预订前多比较几个网站的价格和服务，以找到最适合自己的机票。同时，关注各网站的优惠活动和使用折扣券也能帮助节省费用。