最终艾伦被三笠杀死使始祖尤弥尔从爱情的束缚中解脱得到自由从而使巨人之力从世上消失。
《进击的巨人》第四季结局是一个奇怪的男人出现，艾伦也通过吉克的王血进入了道路，激活了始祖巨人，继续自己的终极目标。在这个漫画里面，只有始祖巨人和进击巨人才可以预知未来，所以众人都不知道艾伦想毁灭世界的真正目的是什么，也就完全无法阻止他的行动，艾伦在这个过程中还找到了很多的同盟军。
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艾伦是曾经生活在西甘锡纳区的少年,与三笠·阿克曼、阿明·阿诺德是从小的玩伴，关系很好。拥有强韧的精神力量与非凡的行动力，对墙壁外的世界拥有比任何人都要强烈的憧憬，从小便立志要加入调查兵团。在目睹了母亲被巨人吞食后，立誓要驱逐所有的巨人。曾被父亲注射过与巨人能力有关的一针，拥有着可能揭示巨人秘密的地下室钥匙。
参考资料：百度百科-艾伦·耶格尔
本回答被网友采纳最后艾伦被三笠亲手杀死了。
在天与地之战中（地鸣篇），三笠与爱尔敏等人搭乘飞艇成功抵达艾伦的所在位置，皮克将炸药缠绕住艾伦（始祖巨人型态）的颈部打算炸断其的头部，不料被始祖尤弥尔利用战槌的力量做出的战槌巨人阻止，爱尔敏也被另一只狓型态的巨人夺走，使众人陷入危机。
正在众人陷入危机之时，法尔可变身的巨人与贾碧和亚妮赶到现场支援才拯救了大家。贾碧告诉大家她在艾伦与吉克接触时的瞬间看见了从艾伦身体跳出一条发光的蜈蚣连接至艾伦的头部，并推测其为所有巨人之力的起源，如果将艾伦头部炸断说不定能够再次见到那条怪虫。
最后让成功引爆炸药，轰断了艾伦的颈部，使其头部掉落至地面，此时形似怪诞虫的生物再次出现打算连接回艾伦的头部，莱纳（巨人型态）将其抱住阻止其连接至艾伦头部，从道路回来的爱尔敏也在此时变身，下定了决心决定杀死艾伦。
变身为超大型巨人的爱尔敏成功炸毁了艾伦的巨人骨架，岂料艾伦并未因此死亡，而是从断落的头部长出身体变成超大型巨人与爱尔敏对抗，然而爱尔敏依然不是艾伦的对手，头部被重创，此时利威尔利用雷枪将其牙齿炸断，由三笠飞进艾伦的口中见到艾伦的本体并将其头部斩下，并抱起头颅伤心欲绝。
死后，三笠将其埋葬于西干希娜区外儿时常休憩的树下。并在死后三年类似化为一只鸟为三笠围上围巾，然后飞向远方。
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地鸣篇（30~34卷）梗概——
兄弟二人在“道路”见到了始祖尤米尔，但艾连不同意吉克的安乐死计划，使用始祖巨人之力操控尤米尔，唤醒了沉睡城墙中的超大型巨人，自己则化身为脊椎骨外露的千足虫型态（巨人之力的源头），率领成千上万只巨人开始渡海欲踏平世界。
被弗洛克挟持的汉吉趁隙逃跑后，救下重伤的里维，遇上撤退的马迦特、皮克等玛雷战士，双方因目标一致暂时组成同盟。与阿尔敏、米卡莎、解除硬质化的亚妮等人会合后，欲夺取港口附近载有飞艇的轮船，但遭叶卡派强力抵抗，同盟军不得不与昔日同袍兵刃相向。
抢夺船只成功后，马迦特与训练兵时期的夏迪斯教官自愿断后，自爆炸毁可供叶卡派追击的船只；中间弗洛克舍命破坏飞艇油箱，汉吉为了给未完全修复的飞艇争取时间，在交付团长职务予阿尔敏后，持刀阻击超大型巨人而被蒸气烫死。
分秒必争下，亚妮、贾碧、法尔可等人留在船上，其余众人乘飞艇启航，做出杀死艾连以阻止地鸣的决定。飞抵艾连变身的始祖巨人上空后，欲炸断其后颈，但遭艾连身上幻化的历代九大巨人阻拦，即将全军覆没之际，法尔可化为兽鸟型态飞来救援。
阿尔敏被吞噬至始祖体内与吉克对话，吉克领悟生命的意义后让里维杀掉他，地鸣停止。阿尔敏与莱纳联合摧毁千足虫的骨架，然而千足虫无损，释放毒气令普通艾尔迪亚人全员巨人化。艾连向米卡莎传送记忆，描述两人避世私奔的另一种可能性后，米卡莎斩落艾连的头颅，与之深吻以示道别。
艾连死后，阿尔敏想起了早前曾与艾连在“道路”谈话。艾连将这段记忆暂时封印，目的是让伙伴们以救世英雄的姿态杀掉自己，断绝巨人之力的传承。最终艾尔迪亚族摆脱巨人之力，在岛内外科技水平相近的情况下，人类将持续著与巨人再无瓜葛的政治角力乃至战争。而三笠·阿克曼则带着艾伦的残骸回到墙内，孤独地渡过下半生。