果园选择草甘膦钾盐作为除草剂是一种常见做法，因为它对果树相对安全且能有效除草。使用草甘膦钾盐时，一般建议在阴天或晴天无大风的上午9—11时和下午4—7时进行喷施。避免在中午烈日下使用，因为高温会导致草甘膦失效，药液被晒干后影响杂草对其的吸收。同样，雨、露水未干时也不宜使用，因为此时杂草细胞水分饱和，不利于药液吸收，且喷雾雾滴易与雨露结合生成大的药水滴，掉落在土中使草甘膦在土中被钝化而失效。
在杂草生育期中，应选择杂草大量出土、生长最旺盛的时候用药。杂草的种子、宿根在土中分布有深浅之分，发芽出土时间有先后的不同。当杂草未大量出土时使用，只喷到了出土的少量杂草，防除效果不好，且浪费人力、物力和财力，又污染环境；若在杂草生育后期甚至快枯死时使用，由于杂草组织老化，绿叶面积减少，影响草甘膦的内吸性和在杂草体内的传导、输送，除草效果较差。
温度对草甘膦的效果也有影响。温度高时，杂草吸收药剂的速度快、数量多、代谢分解困难，容易达到除草的目的。在日平均气温10℃以上使用除草剂，其防治效果可达80%以上。15-25℃范围内，效果最好，但不以不超过30℃为宜，过高的温度容易引起施药品人员中毒，有的除草剂在高温下施用还会造成药害。温度低于10℃时药效只有一半，低于5℃时基本无效。因此，低温季节使用除草剂，一定要抓住温度较高时进行。
在使用草甘膦时，也要注意混用问题。例如，百草枯为触杀型除草剂而草甘膦为内吸传导型除草剂，混用时要注意比例。我国现有已登记的两种混配的除草剂，混用比例为：草甘膦：百草枯37.8：2.2。
此外，要注意的是，草甘膦虽然对果树相对安全，但在葡萄、猕猴桃、核桃、杨梅、香蕉、火龙果、桑树等果园内是严禁使用，因为这些果树的根系都比较浅，一旦使用草甘膦，就有可能使草甘膦通过土壤渗透而被这些果树的根系所吸收，从而造成这些果树的死亡。对于桉树，虽然草甘膦是树苗除草剂的首选除草剂，但在使用过程中，尽量避免喷施到桉树上，喷施的时候最好能够保护好桉树周围地表，不要让除草剂流到土壤，不然会影响桉树的生长，产生药害。建议，喷施草甘膦后，过几天喷施除草安全添加剂等解除除草剂药害的制剂，这样就可以降低除草剂对桉树的影响，缓解除草剂副作用，既能起到除草效果，又能降低对树的影响。如果面积小的话，最好选择人工除草，安全可靠。
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