环境影响评估
生物安全三级实验室因其实验活动涉及的病原微生物对人体、环境和社会的危害或潜在危害极大，已引起国家的高度重视和公众的广泛关注。尤其是近年来全球多家研究机构相继发生SARS实验室感染事件后，国家更是全方位加强了对生物安全三级实验室的监督管理。环保部门也加强了涉及生物安全实验室建设项目的环境影响审批工作，一度要求所有涉及高等级生物安全实验室的建设项目都由国家环保部直接进行审批。《病原微生物实验室生物安全管理条例》（国务院2018）规定，环评应“依照《中华人民共和国环境影响评价法》的规定进行环境影响评价并经环境保护主管部门审查批准”。目前，环评的做法是，经有相关资质的环境评价单位全面评估后，编制《环评报告书》，交给所在地方政府环境保护主管部门（不同地方审批权授权有所不同，省、市、县区都有）审批。 已经建成并通过实验室国家认可的生物安全三级实验室应当向所在地的县级人民政府环境保护主管部门备案。环境保护主管部门依照法律、行政法规的规定对实验室排放的废水、废气和其他废物处置情况进行监督检查。
科技部建设审查
根据《病原微生物实验室生物安全管理条例》（国务院2018）相关要求，新建、改建、扩建三级实验室或者生产、进口移动式三级实验室，在符合国家生物安全实验室体系规划并依法履行有关审批手续的基础上，应当经国务院科技主管部门审查同意。科技部审查主要包括以下内容：（1）实验室建设的基本构想，具体包括拟建设实验室规格和类型、建设地址、拟建设规模、时间进度安排；（2）申请单位职能范畴及基本情况；（3）必要性分析，包括与国家生物安全实验室体系建设规划相符性说明、行业政策要求或发展需求、地区政策要求或发展需求；（4）可行性分析，包括前期工作基础、有效保障实验室安全运行的设施设备、有效保障实验室安全运行的人员队伍、运行管理制度及保障机制、建设经费与筹资方式；（5）实验室建成后的管理安排，包括组织管理模式、运行机制；（6）建设与运行风险评估及对策。
实验室设计
高等级生物安全实验室建筑不同于普通建筑，其建设是一项比较复杂的系统工程，要综合考虑实验室总体规划、工艺流程、 建筑结构、装饰装修、通风空调、给排水、电气自控、消防、环保等方方面面条件，安全、高效、舒适、节能、环保是生物安全实验室建设的理想要素。
生物安全实验室设计过程中应严格按照建筑技术规范要求，并充分体现计划开展实验活动的适用性。高等级生物安全实验室设计者除应具备实验室工程设计与建筑的知识外，同时还应充分了解实验室工作流程、实验室仪器设备、生物安全等相关知识。
实验室主体工程建设
实验室主体工程建设主要内容包括建筑物抗震加固、围护结构建设、通风系统、空调系统、自控系统、电气、送排风过滤系统、污水处理系统等。《生物安全实验室建筑技术规范》规定，生物安全实验室的抗震应符合现行国家标准《建筑抗震设防分类标准》（GB50223—2018）的有关规定。生物安全三级实验室抗震设防类别宜按特殊设防类。
实验室生物安全认可
按照《实验室生物安全通用要求》规定，符合国家生物安全实验室体系规划并依法履行有关审批手续，科技部建设审查通过，按照规范建设好并通过建设质量验收的生物安全三级实验室，应向中国合格评定国家认可委员会（CNAS）申请进行实验室认可，获得认可通过后获颁生物安全三级实验室认可证书。
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