法律分析：1、办理手续和人员不同
在单位办理退休，个人只负责向单位人力资源部门提供所需要的资料，如本人身份证、户口簿、社保本、照片等，其余送审等由单位帮助办理。个人退休要个人去社保机构办理退休
2、女性退休年龄，有5年的差距
一般条件下作为企业的在职职工，并且自己是女性工人身份，那么完全是可以按照50岁的年龄，来办理退休享受这个养老金的待遇。
但是如果自己虽然在企业单位工作，自己并不是女性工人身份，而是女性干部身份，那么这样的话就不能够按照50岁来办理退休了，只能够按照55岁才能够办理退休享受养老金的待遇，所以说，女性干部身份和女性工人身份，也是影响自己能不能够按照50岁，办理退休的一个重要条件。
3、个人档案的归属问题
因为灵活就业人员没有单位托管个人档案，所以说大多数情况下个人档案，都会在你户籍所在地的人才交流开发中心。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》 第七十条 国家发展社会保险事业，建立社会保险制度，设立社会保险基金，使劳动者在年老、患病、工伤、失业、生育等情况下获得帮助和补偿。