用人单位扣了工资没有缴纳社保，劳动者可以向社会保险行政部门举报，由社会保险行政部门责令限期缴纳；逾期不改正的，对用人单位处应缴社会保险费数额一倍以上三倍以下的罚款。
1、用人单位未依法为劳动者缴纳社会保险的，劳动者可以此解除劳动合同，并要求支付经济补偿；
2、劳动者与用人单位解除劳动关系后，如果用人单位处于存续期间，劳动者可以在两年之内向社会保险经办机构和劳动保障行政部门举报和投诉，通过该机构责令用人单位按规定补缴社会保险费；
3、两年的时效从用人单位最后一次少报缴费工资的行为终了之日起计算，如果超过两年，社会保险经办机构和劳动保障行政部门不予受理；
4、劳动者可以要求用人单位补缴；
5、不补缴的，劳动者可以向当地的劳动行政部门投诉，由社会保险费征收机构责令限期缴纳或者补足，并自欠缴之日起，按日加收万分之五的滞纳金。
公司把社保钱扣了的解决方法：
1、公司已经扣了社保的钱，但是公司不给你交社保的行为显然也是违法的，你可以要求公司给你补缴；
2、同时，你已经离开公司，你的离职可以以公司未依法缴纳社保而被迫解除劳动合同的，并主张经济补偿。工作年限月平均工资。（六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。）公司不仅未履行给员工缴纳养老保险的义务，同时还将员工应缴部分扣除后挪作他用，两种行为均违反国家相关法规，侵害了员工权益，而后者的性质更加恶劣；
3、对此，员工可向劳动监察大队投诉，要求监察部门依法查处学院的违法行为，并要求公司为员工补交养老保险费；员工也可向劳动仲裁机构提起仲裁，维护自己的合法权益。
综上所述，当事人可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解；调解不成，当事人一方请求仲裁的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；一方也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。
【法律依据】：
《中华人民共和国社会保险法》第六十三条
用人单位未按时足额缴纳社会保险费的，由社会保险费征收机构责令其限期缴纳或者补足。
用人单位逾期仍未缴纳或者补足社会保险费的，社会保险费征收机构可以向银行和其他金融机构查询其存款账户；并可以申请县级以上有关行政部门作出划拨社会保险费的决定，书面通知其开户银行或者其他金融机构划拨社会保险费。用人单位账户余额少于应当缴纳的社会保险费的，社会保险费征收机构可以要求该用人单位提供担保，签订延期缴费协议。
用人单位未足额缴纳社会保险费且未提供担保的，社会保险费征收机构可以申请人民法院扣押、查封、拍卖其价值相当于应当缴纳社会保险费的财产，以拍卖所得抵缴社会保险费。
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