根据国家区域发展总体战略与重要经济区布局，重要经济区地质环境调查在空间上可按照四大区带进行布局：环渤海及京津冀协同发展地区、丝绸之路经济带（境内部分）、长江经济带和泛珠江三角洲地区。
环渤海及京津冀协同发展地区：覆盖北京、天津、河北沿海地区、辽宁沿海经济带、沈阳经济区、黄河三角洲高效生态经济区、山东半岛蓝色经济区，延及冀中南地区、太原城市群、中原城市群、长吉图经济区、哈大齐工业走廊等重点开发区域，重点开展含水层及地下水开发引发的地质环境问题、环渤海海岸带、活动断裂调查。针对地下水长期超采及所引发的地面沉降、地裂缝等地质环境问题，推进1∶5万水环地质调查与地下水水质调查，查明包气带结构、含水层空间结构与地下水补径排条件，评价区域地下水资源量、开发利用潜力、地下水污染状况，加强南水北调对沿线地区地下水影响研究，为地下水资源开发利用、地面沉降等地质环境问题治理、地下水污染防治等提供基础地质资料。针对环渤海海岸带地区工程建设与侵蚀淤积、岸线变迁、海水入侵等地质环境问题，开展1∶5万水工环综合调查，查明海岸带工程地质条件、海陆地下水相互作用等，为海岸带工程建设、淡水资源开发与生态保护提供地质依据。针对活动断裂与地震活动影响，开展主要活动断裂与区域地壳稳定性调查，查明地质构造格架、主要活动断裂空间分布规律与活动特征，为国土空间开发规划编制和重大工程建设与运营提供地质依据。对于沈阳经济区、太原城市群、冀中南地区等资源型城市分布区或矿集区，加强矿山特别是煤炭矿山水文地质、环境地质调查。对于基本农田和城市周边地区，加强1∶5万土地质量地球化学调查。
丝绸之路经济带（境内部分）：覆盖关中—天水经济区、晋陕豫黄河金三角区域、呼包鄂榆地区、宁夏沿黄经济区、兰州—西宁地区、天山北坡地区等，重点开展水文地质调查、城市与重大工程建设区工程地质调查、突发性地质灾害调查。围绕地下水开发与保护，开展1∶25万水文地质调查与重点区1∶5万水文地质调查，查明包气带结构、含水层空间结构与地下水补径排条件，加强地下水的生态功能研究，评价区域地下水资源量、开发利用潜力和地下水生态流量，为地下水地表水开发利用、地面沉降与地裂缝防治、生态保护提供基础资料。针对城镇化建设与重大工程及基础设施建设，开展城镇区、重大工程建设区或沿线区区域地质调查和工程地质调查，查明城镇区、重大工程区区域地质背景、工程地质条件和黄土湿陷、沙土液化等工程地质问题，为城市地下空间开发利用、重要基础设施建设和重大交通工程、能源工程建设等提供基础地质资料。以威胁城镇地区的滑坡、崩塌等突发性地质灾害为重点，开展1∶5万地质灾害调查，查明地质灾害空间分布与发生机理，评估地质灾害风险，为城镇地区地质灾害防治提供基础依据。对于晋陕豫黄河金三角区域、呼包鄂榆地区、准东等矿集区或能源、化工与原材料基地，加强矿山水文地质与环境地质调查，评估资源开发对生态系统的影响。对于基本农田和城市周边地区，加强1∶5万土地质量地球化学调查。
长江经济带：覆盖长江三角洲地区、江苏沿海地区、皖江城市带、鄱阳湖生态经济区、武汉城市圈、长株潭城市群、洞庭湖生态经济区、成渝经济区，延及黔中地区、滇中地区，重点开展地下水与土壤污染调查、突发性地质灾害调查、矿山地质环境调查、重大工程建设区工程地质调查、活动断裂调查等。以长江三角洲地区、武汉城市圈、长株潭城市群等为重点，推进1∶5万水文地质调查，加强地下水与土壤污染调查，查明地下水与土壤污染状况，为水土污染防治提供基础数据与资料。以成渝、滇中、黔中、洞庭湖等经济区的山地丘陵区为重点，开展1∶5万滑坡、崩塌、泥石流等突发性地质灾害调查；以武汉城市圈、皖江城市带、长株潭城市群等为重点，开展岩溶塌陷调查，为地质灾害防治提供基础资料。以皖江、鄱阳湖、成渝等重要经济区的矿集区或资源型城市为重点，开展煤炭、金属矿山地质环境调查，查明矿产资源开发造成的地质灾害与水土污染分布，为矿山环境治理提供基础资料。针对国家规划建设的交通、水利等重大工程和城镇区基础设施建设，开展区域地质调查与工程地质调查，查明影响重大工程建设的重要工程地质问题，为重大工程建设与城市基础设施建设提供地质依据。以成渝、滇中等经济区为重点，开展活动断裂与地壳稳定性调查，查明活动断裂的空间分布、地震地质灾害机理，为重大工程建设、城镇建设和地质灾害防治提供基础依据。针对长江三角洲地区的地面沉降，继续开展地面沉降调查与监测。对于基本农田和城市周边地区，加强1∶5万土地质量地球化学调查。
泛珠江三角洲地区：覆盖海峡西岸经济区、珠江三角洲地区、北部湾经济区、珠江—西江经济带和海南岛，重点开展地下水与土壤污染调查、地质灾害调查、海岸带重大工程建设区工程地质调查。针对珠江三角洲地区严重污染问题，开展地下水与土壤污染调查，查明地下水质量时空变化规律，为地下水与土壤污染防治提供基础数据与资料。以珠江三角洲、北部湾经济区、雷琼地区等为重点，开展1∶25万与1∶5万水文地质调查，评价地下水资源量与地下水开发利用潜力，圈定城市应急供水水源地，为地下水开发利用提供基础资料。以珠江三角洲和珠江—西江经济带为重点，开展岩溶塌陷调查，查明地下岩溶分布、岩溶塌陷形成演化规律，为岩溶塌陷治理提供地质依据；以海峡西岸、珠江—西江、北部湾等经济区山地丘陵区为重点，开展滑坡、崩塌、泥石流等突发性地质灾害调查，查明台风暴雨引发的地质灾害空间分布与形成机理，为地质灾害防治提供地质依据。针对海岸带工程建设、围海造陆、城镇基础设施建设，开展海岸带重大工程建设区与城镇地区工程地质调查，查明工程地质条件、活动断裂展布和工程地质问题，为重大工程建设和城市地下空间开发提供基础资料。对于基本农田和城市周边地区，加强1∶5万土地质量地球化学调查。