不能免掉扣分，闯红灯交了罚款也还是要扣分的。
闯红灯的交通违章处罚是两方面同步的，既要缴罚款，还要主记分。一般是需要到当地的车辆管理所去处理消分，消完分后还需要拿着处罚单到指定的银行交罚款，这二项都要处理。如果不交罚款，被扣的6分自动转到下一个记分周期。
如果是一些特殊情况闯红灯被扣了6分是可以免掉的，比如说在等车时遇到消防车、救护车等特殊车辆经过时让道导致的闯红灯就可以申请免掉的。还有在道路堵的水泄不通的情况下在场交警指挥动作与红绿灯不符被拍到扣分也可以申请免掉的。除此外还有前方车辆突然变化只能闯红灯来紧急避让、自己车被套牌然后闯了红灯等等都可以到交警部门进行申诉并说明情况，核验后会撤销罚单，网络中有很多说法都介绍由于前面是大卡车挡住了视线闯了红灯是可以去交警大队消除的，实际上不要太当真，正确的做法是应该与前方大车保持安全距离，保证自己的视线可以观察到指示灯的颜色变化。日常开车时一定要遵守交通规则，安全驾驶免受处罚，不仅是对自己负责任也是对他人负责任。
法律依据：
《机动车驾驶证申领和使用规定》
第七十一条 公安机关交通管理部门对机动车驾驶人的道路交通安全违法行为，除依法给予行政处罚外，实行道路交通安全违法行为累积记分制度，记分周期为12个月，满分为12分。
机动车驾驶人在一个记分周期内记分达到12分的，应当按规定参加学习、考试。
《中华人民共和国道路交通安全法》
第九十九条 有下列行为之一的，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款：
（一）未取得机动车驾驶证、机动车驾驶证被吊销或者机动车驾驶证被暂扣期间驾驶机动车的；
（二）将机动车交由未取得机动车驾驶证或者机动车驾驶证被吊销、暂扣的人驾驶的；
（三）造成交通事故后逃逸，尚不构成犯罪的；
（四）机动车行驶超过规定时速百分之五十的；
（五）强迫机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规和机动车安全驾驶要求驾驶机动车，造成交通事故，尚不构成犯罪的；
（六）违反交通管制的规定强行通行，不听劝阻的；
（七）故意损毁、移动、涂改交通设施，造成危害后果，尚不构成犯罪的；
（八）非法拦截、扣留机动车辆，不听劝阻，造成交通严重阻塞或者较大财产损失的。
行为人有前款第二项、第四项情形之一的，可以并处吊销机动车驾驶证；有第一项、第三项、第五项至第八项情形之一的，可以并处十五日以下拘留。
《道路交通安全违法行为记分管理办法》
第十条 机动车驾驶人有下列交通违法行为之一，一次记6分：
（一）驾驶校车、公路客运汽车、旅游客运汽车载人超过核定人数未达到百分之二十，或者驾驶7座以上载客汽车载人超过核定人数百分之二十以上未达到百分之五十，或者驾驶其他载客汽车载人超过核定人数百分之五十以上未达到百分之百的；
（二）驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速未达到百分之二十，或者在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之二十以上未达到百分之五十的；
（三）驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆以外的机动车在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速百分之二十以上未达到百分之五十，或者在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之五十以上的；
（四）驾驶载货汽车载物超过最大允许总质量百分之五十以上的；
（五）驾驶机动车载运爆炸物品、易燃易爆化学物品以及剧毒、放射性等危险物品，未按指定的时间、路线、速度行驶或者未悬挂警示标志并采取必要的安全措施的；
（六）驾驶机动车运载超限的不可解体的物品，未按指定的时间、路线、速度行驶或者未悬挂警示标志的；
（七）驾驶机动车运输危险化学品，未经批准进入危险化学品运输车辆限制通行的区域的；
（八）驾驶机动车不按交通信号灯指示通行的；
（九）机动车驾驶证被暂扣或者扣留期间驾驶机动车的；
（十）造成致人轻微伤或者财产损失的交通事故后逃逸，尚不构成犯罪的；
（十一）驾驶机动车在高速公路或者城市快速路上违法占用应急车道行驶的。
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