乳糖不耐受和牛奶过敏症状类似，有腹痛、腹胀、腹泻。但是它们之间有本质的区别：
发病机制不同
乳糖不耐受发生在消化系统。小肠粘膜细胞分泌的乳糖酶不足，不能完全分解牛奶中的乳糖。未分解的乳糖会直接进入大肠，在大肠内被微生物发酵分解，产生气体。肠道内PH值降低，刺激肠道蠕动，导致腹胀腹泻。
牛奶过敏，准确的说是对牛奶中的蛋白质过敏。每100毫升牛奶含有3克蛋白质，其中80%是酪蛋白，20%是乳清蛋白。过敏的发生一般以免疫系统为主。儿童消化道免疫屏障功能尚未成熟，黏膜柔软，血管通透性高。蛋白质容易通过肠粘膜进入血液，被免疫系统识别，被误认为“敌人”而攻击，导致机体出现过敏症状，如腹痛、腹泻、呕吐、哮喘等。严重过敏可能危及生命。
大多数情况下，这种过敏症状会随着年龄的增长而逐渐消失，约三分之一的患者会持续到童年，只有0.1%-1%的成年人对牛奶过敏或对生活过敏。
牛奶过敏有一定的遗传倾向。据研究统计，牛奶过敏发生率为2%-5%，父母双方均无过敏体质，婴儿牛奶过敏发生率为2%，父母一方有过敏史，发生率为20%，父母双方均有过敏史，婴儿过敏发生率可达43%。
人口不一样
乳糖不耐受在婴儿中较少发生，在成人中较多。牛奶过敏在婴儿中更常见，但在成人中不太常见。
大多数婴儿的主要食物是(母乳)，乳糖酶通常分泌在肠道中，帮助消化和代谢。还有一小部分婴儿天生乳糖酶缺乏，需要特殊的无乳糖配方奶喂养。
通常在断奶后，婴儿的乳糖酶合成会逐渐减少。当小肠由于各种原因缺乏乳糖酶时，就容易出现乳糖不耐受的症状。
根据一些数据，乳糖不耐症在欧美，白人中不太常见，而乳糖不耐症在黄种人中更常见。这可能与不同民族的饮食文化习惯不同有关。
解决成人乳糖不耐受的症状，可以多喝几次牛奶，少量；或者一起吃食物和牛奶；选择酸奶和奶酪缓解症状。
如果成年人对牛奶过敏，唯一的解决办法是避免所有含有乳制品的食物，代之以其他食物，如豆浆。
如果怀疑为牛奶蛋白过敏，可以做皮肤点刺试验、食物激发试验等。治疗上需要饮食回避，无好转则需要深度水解蛋白或者氨基酸配方奶粉喂养。
乳糖酶缺乏全球儿童都有，是以乳汁为主要饮食的新生儿及婴幼儿中常发生的症状。 牛奶蛋白过敏是奶汁中的蛋白质混合介导的异常免疫反应。
乳糖不耐受是“乳糖”引起的，牛奶蛋白过敏是“蛋白”引起的 。